Protein–RNA interactions for Protein: P05977

Myl1, Myosin light chain 1/3, skeletal muscle isoform, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myl1P05977 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Myl1P05977 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Myl1P05977 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Myl1P05977 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Myl1P05977 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Myl1P05977 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Myl1P05977 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Myl1P05977 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Myl1P05977 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Myl1P05977 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Myl1P05977 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Myl1P05977 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Myl1P05977 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Myl1P05977 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Myl1P05977 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Myl1P05977 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Myl1P05977 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Myl1P05977 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Myl1P05977 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Myl1P05977 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Myl1P05977 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Myl1P05977 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Myl1P05977 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Myl1P05977 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Myl1P05977 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Myl1P05977 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Myl1P05977 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Myl1P05977 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Myl1P05977 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Myl1P05977 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Myl1P05977 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Myl1P05977 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Myl1P05977 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Myl1P05977 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Myl1P05977 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Myl1P05977 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Myl1P05977 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Myl1P05977 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Myl1P05977 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Myl1P05977 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Myl1P05977 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Myl1P05977 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Myl1P05977 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Myl1P05977 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Myl1P05977 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Myl1P05977 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Myl1P05977 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Myl1P05977 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Myl1P05977 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Myl1P05977 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Myl1P05977 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Myl1P05977 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Myl1P05977 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Myl1P05977 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Myl1P05977 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Myl1P05977 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Myl1P05977 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Myl1P05977 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Myl1P05977 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Myl1P05977 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Myl1P05977 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Myl1P05977 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Myl1P05977 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Myl1P05977 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Myl1P05977 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Myl1P05977 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Myl1P05977 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Myl1P05977 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Myl1P05977 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Myl1P05977 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Myl1P05977 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Myl1P05977 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Myl1P05977 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Myl1P05977 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Myl1P05977 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Myl1P05977 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Myl1P05977 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Myl1P05977 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Myl1P05977 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Myl1P05977 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Myl1P05977 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Myl1P05977 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Myl1P05977 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Myl1P05977 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Myl1P05977 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Myl1P05977 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Myl1P05977 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Myl1P05977 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Myl1P05977 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Myl1P05977 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Myl1P05977 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Myl1P05977 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Myl1P05977 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Myl1P05977 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Myl1P05977 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Myl1P05977 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Myl1P05977 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Myl1P05977 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Myl1P05977 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Myl1P05977 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms