Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-Ab1P01921 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-Ab1P01921 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-Ab1P01921 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-Ab1P01921 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-Ab1P01921 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-Ab1P01921 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-Ab1P01921 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-Ab1P01921 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-Ab1P01921 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-Ab1P01921 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-Ab1P01921 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-Ab1P01921 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-Ab1P01921 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-Ab1P01921 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-Ab1P01921 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-Ab1P01921 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-Ab1P01921 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-Ab1P01921 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-Ab1P01921 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-Ab1P01921 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-Ab1P01921 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-Ab1P01921 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-Ab1P01921 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-Ab1P01921 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-Ab1P01921 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-Ab1P01921 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-Ab1P01921 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-Ab1P01921 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-Ab1P01921 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-Ab1P01921 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-Ab1P01921 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-Ab1P01921 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-Ab1P01921 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-Ab1P01921 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-Ab1P01921 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-Ab1P01921 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-Ab1P01921 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-Ab1P01921 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-Ab1P01921 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-Ab1P01921 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-Ab1P01921 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-Ab1P01921 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-Ab1P01921 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-Ab1P01921 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-Ab1P01921 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-Ab1P01921 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-Ab1P01921 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-Ab1P01921 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-Ab1P01921 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-Ab1P01921 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-Ab1P01921 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-Ab1P01921 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-Ab1P01921 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
H2-Ab1P01921 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
H2-Ab1P01921 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
H2-Ab1P01921 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-Ab1P01921 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-Ab1P01921 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-Ab1P01921 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-Ab1P01921 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-Ab1P01921 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-Ab1P01921 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-Ab1P01921 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-Ab1P01921 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-Ab1P01921 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-Ab1P01921 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-Ab1P01921 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-Ab1P01921 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-Ab1P01921 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-Ab1P01921 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-Ab1P01921 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-Ab1P01921 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-Ab1P01921 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-Ab1P01921 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-Ab1P01921 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-Ab1P01921 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-Ab1P01921 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-Ab1P01921 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-Ab1P01921 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-Ab1P01921 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-Ab1P01921 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-Ab1P01921 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-Ab1P01921 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-Ab1P01921 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-Ab1P01921 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-Ab1P01921 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-Ab1P01921 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-Ab1P01921 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-Ab1P01921 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-Ab1P01921 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-Ab1P01921 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-Ab1P01921 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-Ab1P01921 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-Ab1P01921 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-Ab1P01921 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-Ab1P01921 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2-Ab1P01921 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2-Ab1P01921 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-Ab1P01921 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms