Protein–RNA interactions for Protein: P01791

Ig heavy chain V region HPCM6, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01791 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01791 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01791 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01791 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01791 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01791 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01791 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01791 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01791 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01791 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01791 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01791 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01791 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01791 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01791 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01791 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01791 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01791 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01791 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01791 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01791 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01791 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01791 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01791 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01791 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01791 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01791 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01791 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01791 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01791 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01791 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01791 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01791 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01791 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01791 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01791 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01791 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01791 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01791 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01791 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01791 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01791 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01791 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
P01791 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01791 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01791 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01791 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01791 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01791 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01791 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01791 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01791 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01791 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01791 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01791 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01791 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
P01791 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01791 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01791 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01791 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01791 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01791 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01791 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01791 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01791 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01791 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01791 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01791 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01791 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01791 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01791 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01791 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01791 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01791 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01791 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01791 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01791 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01791 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01791 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01791 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01791 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01791 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01791 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01791 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01791 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01791 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01791 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01791 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01791 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01791 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01791 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01791 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
P01791 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01791 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01791 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01791 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01791 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01791 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01791 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01791 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms