Protein–RNA interactions for Protein: P01747

Ig heavy chain V region 36-65, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01747 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01747 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01747 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01747 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01747 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01747 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01747 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01747 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01747 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01747 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01747 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01747 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01747 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01747 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01747 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01747 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01747 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01747 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
P01747 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
P01747 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01747 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01747 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01747 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01747 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01747 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01747 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
P01747 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01747 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01747 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01747 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01747 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01747 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01747 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01747 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01747 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01747 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01747 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01747 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01747 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01747 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01747 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01747 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01747 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
P01747 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01747 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01747 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01747 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01747 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01747 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01747 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01747 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P01747 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01747 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01747 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01747 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01747 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01747 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01747 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01747 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01747 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01747 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01747 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01747 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01747 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01747 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01747 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01747 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01747 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01747 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
P01747 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01747 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01747 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01747 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01747 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01747 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01747 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01747 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01747 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P01747 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01747 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01747 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01747 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01747 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01747 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01747 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01747 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01747 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01747 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01747 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01747 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01747 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01747 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01747 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01747 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01747 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01747 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01747 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01747 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01747 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01747 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms