Protein–RNA interactions for Protein: P01736

T-cell receptor beta chain V region PHDS203 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01736 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01736 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01736 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01736 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01736 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P01736 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01736 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01736 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01736 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01736 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01736 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01736 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01736 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01736 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01736 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01736 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01736 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01736 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01736 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01736 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01736 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01736 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01736 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01736 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01736 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01736 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01736 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01736 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01736 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01736 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01736 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01736 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01736 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01736 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01736 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01736 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01736 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01736 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01736 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01736 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01736 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01736 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01736 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01736 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01736 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01736 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01736 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01736 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01736 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01736 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01736 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01736 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01736 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01736 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01736 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01736 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01736 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01736 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01736 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01736 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01736 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01736 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01736 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01736 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01736 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01736 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01736 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01736 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01736 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01736 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01736 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01736 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01736 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01736 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01736 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01736 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01736 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01736 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01736 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01736 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01736 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01736 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01736 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01736 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01736 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01736 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01736 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01736 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01736 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01736 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01736 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01736 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01736 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01736 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01736 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01736 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01736 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01736 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01736 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01736 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms