Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ifnb1P01575 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ifnb1P01575 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ifnb1P01575 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ifnb1P01575 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ifnb1P01575 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ifnb1P01575 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ifnb1P01575 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ifnb1P01575 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ifnb1P01575 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ifnb1P01575 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ifnb1P01575 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ifnb1P01575 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ifnb1P01575 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ifnb1P01575 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ifnb1P01575 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ifnb1P01575 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ifnb1P01575 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ifnb1P01575 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ifnb1P01575 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ifnb1P01575 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ifnb1P01575 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ifnb1P01575 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ifnb1P01575 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ifnb1P01575 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ifnb1P01575 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ifnb1P01575 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ifnb1P01575 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ifnb1P01575 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ifnb1P01575 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ifnb1P01575 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ifnb1P01575 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ifnb1P01575 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ifnb1P01575 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ifnb1P01575 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ifnb1P01575 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ifnb1P01575 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ifnb1P01575 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ifnb1P01575 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ifnb1P01575 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ifnb1P01575 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ifnb1P01575 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ifnb1P01575 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ifnb1P01575 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ifnb1P01575 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ifnb1P01575 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ifnb1P01575 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ifnb1P01575 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ifnb1P01575 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ifnb1P01575 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ifnb1P01575 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ifnb1P01575 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ifnb1P01575 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ifnb1P01575 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ifnb1P01575 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ifnb1P01575 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ifnb1P01575 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ifnb1P01575 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ifnb1P01575 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ifnb1P01575 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ifnb1P01575 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ifnb1P01575 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ifnb1P01575 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ifnb1P01575 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ifnb1P01575 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ifnb1P01575 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ifnb1P01575 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ifnb1P01575 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ifnb1P01575 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ifnb1P01575 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ifnb1P01575 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ifnb1P01575 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ifnb1P01575 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ifnb1P01575 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ifnb1P01575 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ifnb1P01575 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ifnb1P01575 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ifnb1P01575 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ifnb1P01575 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ifnb1P01575 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ifnb1P01575 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ifnb1P01575 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ifnb1P01575 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ifnb1P01575 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ifnb1P01575 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ifnb1P01575 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ifnb1P01575 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ifnb1P01575 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ifnb1P01575 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ifnb1P01575 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ifnb1P01575 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ifnb1P01575 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ifnb1P01575 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ifnb1P01575 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ifnb1P01575 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ifnb1P01575 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ifnb1P01575 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ifnb1P01575 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ifnb1P01575 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ifnb1P01575 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms