Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sp1O89090 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sp1O89090 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sp1O89090 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sp1O89090 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sp1O89090 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sp1O89090 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sp1O89090 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sp1O89090 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sp1O89090 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sp1O89090 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sp1O89090 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sp1O89090 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sp1O89090 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sp1O89090 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sp1O89090 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sp1O89090 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sp1O89090 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sp1O89090 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sp1O89090 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sp1O89090 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sp1O89090 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sp1O89090 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sp1O89090 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sp1O89090 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sp1O89090 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sp1O89090 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sp1O89090 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sp1O89090 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sp1O89090 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sp1O89090 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sp1O89090 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sp1O89090 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sp1O89090 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sp1O89090 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sp1O89090 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sp1O89090 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sp1O89090 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Sp1O89090 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sp1O89090 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sp1O89090 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sp1O89090 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sp1O89090 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sp1O89090 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sp1O89090 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sp1O89090 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sp1O89090 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sp1O89090 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sp1O89090 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sp1O89090 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sp1O89090 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sp1O89090 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sp1O89090 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sp1O89090 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sp1O89090 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sp1O89090 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sp1O89090 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sp1O89090 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sp1O89090 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sp1O89090 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sp1O89090 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sp1O89090 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sp1O89090 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sp1O89090 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sp1O89090 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sp1O89090 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sp1O89090 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sp1O89090 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Sp1O89090 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sp1O89090 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Sp1O89090 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sp1O89090 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Sp1O89090 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Sp1O89090 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sp1O89090 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sp1O89090 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sp1O89090 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sp1O89090 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sp1O89090 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sp1O89090 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Sp1O89090 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sp1O89090 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Sp1O89090 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sp1O89090 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Sp1O89090 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sp1O89090 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sp1O89090 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sp1O89090 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sp1O89090 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sp1O89090 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sp1O89090 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sp1O89090 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sp1O89090 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sp1O89090 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sp1O89090 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sp1O89090 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sp1O89090 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sp1O89090 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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