Protein–RNA interactions for Protein: O89033

Cdc6, Cell division control protein 6 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc6O89033 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdc6O89033 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdc6O89033 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdc6O89033 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdc6O89033 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdc6O89033 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdc6O89033 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdc6O89033 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdc6O89033 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdc6O89033 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdc6O89033 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdc6O89033 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdc6O89033 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdc6O89033 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdc6O89033 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdc6O89033 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdc6O89033 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdc6O89033 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdc6O89033 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdc6O89033 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdc6O89033 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdc6O89033 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdc6O89033 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdc6O89033 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc6O89033 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc6O89033 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc6O89033 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc6O89033 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc6O89033 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdc6O89033 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdc6O89033 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdc6O89033 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdc6O89033 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdc6O89033 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdc6O89033 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdc6O89033 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdc6O89033 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdc6O89033 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc6O89033 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc6O89033 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc6O89033 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc6O89033 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc6O89033 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc6O89033 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdc6O89033 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdc6O89033 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdc6O89033 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdc6O89033 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdc6O89033 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdc6O89033 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdc6O89033 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdc6O89033 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdc6O89033 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdc6O89033 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdc6O89033 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdc6O89033 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdc6O89033 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdc6O89033 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdc6O89033 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdc6O89033 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdc6O89033 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdc6O89033 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdc6O89033 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdc6O89033 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdc6O89033 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdc6O89033 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdc6O89033 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdc6O89033 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdc6O89033 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdc6O89033 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdc6O89033 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdc6O89033 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdc6O89033 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdc6O89033 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdc6O89033 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdc6O89033 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdc6O89033 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdc6O89033 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdc6O89033 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdc6O89033 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdc6O89033 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdc6O89033 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdc6O89033 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdc6O89033 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdc6O89033 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdc6O89033 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdc6O89033 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdc6O89033 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdc6O89033 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdc6O89033 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdc6O89033 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdc6O89033 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdc6O89033 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdc6O89033 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdc6O89033 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdc6O89033 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdc6O89033 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdc6O89033 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdc6O89033 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdc6O89033 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94 ms