Protein–RNA interactions for Protein: O88485

Dync1i1, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dync1i1O88485 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dync1i1O88485 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dync1i1O88485 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dync1i1O88485 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dync1i1O88485 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dync1i1O88485 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dync1i1O88485 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dync1i1O88485 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dync1i1O88485 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dync1i1O88485 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dync1i1O88485 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dync1i1O88485 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dync1i1O88485 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dync1i1O88485 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dync1i1O88485 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dync1i1O88485 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dync1i1O88485 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dync1i1O88485 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dync1i1O88485 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dync1i1O88485 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dync1i1O88485 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dync1i1O88485 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dync1i1O88485 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dync1i1O88485 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dync1i1O88485 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dync1i1O88485 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dync1i1O88485 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dync1i1O88485 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Dync1i1O88485 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Dync1i1O88485 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Dync1i1O88485 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dync1i1O88485 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dync1i1O88485 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dync1i1O88485 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dync1i1O88485 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dync1i1O88485 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dync1i1O88485 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dync1i1O88485 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dync1i1O88485 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dync1i1O88485 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dync1i1O88485 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dync1i1O88485 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dync1i1O88485 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dync1i1O88485 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dync1i1O88485 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dync1i1O88485 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dync1i1O88485 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dync1i1O88485 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dync1i1O88485 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dync1i1O88485 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dync1i1O88485 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dync1i1O88485 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dync1i1O88485 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dync1i1O88485 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dync1i1O88485 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Dync1i1O88485 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dync1i1O88485 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dync1i1O88485 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dync1i1O88485 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dync1i1O88485 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dync1i1O88485 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Dync1i1O88485 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dync1i1O88485 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dync1i1O88485 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dync1i1O88485 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dync1i1O88485 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Dync1i1O88485 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dync1i1O88485 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dync1i1O88485 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dync1i1O88485 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dync1i1O88485 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dync1i1O88485 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dync1i1O88485 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dync1i1O88485 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dync1i1O88485 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dync1i1O88485 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dync1i1O88485 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dync1i1O88485 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dync1i1O88485 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dync1i1O88485 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dync1i1O88485 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dync1i1O88485 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dync1i1O88485 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dync1i1O88485 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dync1i1O88485 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dync1i1O88485 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dync1i1O88485 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dync1i1O88485 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Dync1i1O88485 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Dync1i1O88485 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Dync1i1O88485 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Dync1i1O88485 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dync1i1O88485 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dync1i1O88485 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dync1i1O88485 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dync1i1O88485 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dync1i1O88485 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dync1i1O88485 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Dync1i1O88485 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dync1i1O88485 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms