Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
AurkcO88445 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
AurkcO88445 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
AurkcO88445 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AurkcO88445 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
AurkcO88445 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
AurkcO88445 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AurkcO88445 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
AurkcO88445 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AurkcO88445 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
AurkcO88445 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AurkcO88445 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
AurkcO88445 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AurkcO88445 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AurkcO88445 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AurkcO88445 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
AurkcO88445 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
AurkcO88445 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AurkcO88445 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AurkcO88445 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AurkcO88445 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AurkcO88445 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
AurkcO88445 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
AurkcO88445 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
AurkcO88445 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AurkcO88445 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AurkcO88445 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AurkcO88445 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AurkcO88445 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AurkcO88445 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AurkcO88445 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AurkcO88445 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
AurkcO88445 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AurkcO88445 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
AurkcO88445 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
AurkcO88445 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AurkcO88445 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AurkcO88445 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AurkcO88445 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AurkcO88445 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AurkcO88445 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
AurkcO88445 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AurkcO88445 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
AurkcO88445 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
AurkcO88445 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
AurkcO88445 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
AurkcO88445 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
AurkcO88445 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
AurkcO88445 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
AurkcO88445 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
AurkcO88445 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
AurkcO88445 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
AurkcO88445 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AurkcO88445 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
AurkcO88445 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AurkcO88445 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
AurkcO88445 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AurkcO88445 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AurkcO88445 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
AurkcO88445 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
AurkcO88445 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AurkcO88445 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AurkcO88445 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AurkcO88445 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AurkcO88445 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AurkcO88445 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
AurkcO88445 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
AurkcO88445 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AurkcO88445 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AurkcO88445 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AurkcO88445 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AurkcO88445 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AurkcO88445 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AurkcO88445 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AurkcO88445 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
AurkcO88445 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AurkcO88445 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AurkcO88445 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AurkcO88445 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AurkcO88445 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AurkcO88445 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AurkcO88445 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AurkcO88445 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AurkcO88445 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AurkcO88445 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AurkcO88445 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AurkcO88445 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AurkcO88445 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
AurkcO88445 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AurkcO88445 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AurkcO88445 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
AurkcO88445 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
AurkcO88445 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
AurkcO88445 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
AurkcO88445 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AurkcO88445 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AurkcO88445 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AurkcO88445 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AurkcO88445 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AurkcO88445 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms