Protein–RNA interactions for Protein: O88200

Clec11a, C-type lectin domain family 11 member A, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec11aO88200 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clec11aO88200 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clec11aO88200 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clec11aO88200 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Clec11aO88200 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clec11aO88200 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clec11aO88200 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clec11aO88200 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clec11aO88200 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clec11aO88200 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clec11aO88200 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clec11aO88200 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clec11aO88200 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clec11aO88200 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Clec11aO88200 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clec11aO88200 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clec11aO88200 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clec11aO88200 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clec11aO88200 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clec11aO88200 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clec11aO88200 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clec11aO88200 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clec11aO88200 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clec11aO88200 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clec11aO88200 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clec11aO88200 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clec11aO88200 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clec11aO88200 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clec11aO88200 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Clec11aO88200 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clec11aO88200 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Clec11aO88200 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clec11aO88200 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clec11aO88200 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clec11aO88200 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clec11aO88200 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Clec11aO88200 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clec11aO88200 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clec11aO88200 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clec11aO88200 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clec11aO88200 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clec11aO88200 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Clec11aO88200 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clec11aO88200 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clec11aO88200 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clec11aO88200 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clec11aO88200 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Clec11aO88200 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Clec11aO88200 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Clec11aO88200 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clec11aO88200 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clec11aO88200 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clec11aO88200 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clec11aO88200 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clec11aO88200 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clec11aO88200 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Clec11aO88200 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clec11aO88200 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clec11aO88200 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Clec11aO88200 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clec11aO88200 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clec11aO88200 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clec11aO88200 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clec11aO88200 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clec11aO88200 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clec11aO88200 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Clec11aO88200 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clec11aO88200 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clec11aO88200 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clec11aO88200 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clec11aO88200 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clec11aO88200 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clec11aO88200 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clec11aO88200 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Clec11aO88200 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Clec11aO88200 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Clec11aO88200 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clec11aO88200 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clec11aO88200 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clec11aO88200 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clec11aO88200 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clec11aO88200 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clec11aO88200 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clec11aO88200 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clec11aO88200 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clec11aO88200 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clec11aO88200 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clec11aO88200 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clec11aO88200 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clec11aO88200 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clec11aO88200 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clec11aO88200 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clec11aO88200 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clec11aO88200 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clec11aO88200 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clec11aO88200 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Clec11aO88200 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clec11aO88200 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clec11aO88200 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clec11aO88200 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms