Protein–RNA interactions for Protein: O70456

Sfn, 14-3-3 protein sigma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfnO70456 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SfnO70456 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SfnO70456 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SfnO70456 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SfnO70456 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SfnO70456 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SfnO70456 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SfnO70456 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SfnO70456 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SfnO70456 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SfnO70456 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SfnO70456 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SfnO70456 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SfnO70456 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SfnO70456 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SfnO70456 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SfnO70456 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SfnO70456 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SfnO70456 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SfnO70456 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SfnO70456 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SfnO70456 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SfnO70456 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SfnO70456 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SfnO70456 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SfnO70456 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SfnO70456 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SfnO70456 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SfnO70456 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SfnO70456 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SfnO70456 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SfnO70456 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SfnO70456 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SfnO70456 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SfnO70456 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SfnO70456 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SfnO70456 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SfnO70456 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SfnO70456 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SfnO70456 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SfnO70456 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SfnO70456 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SfnO70456 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SfnO70456 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SfnO70456 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SfnO70456 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SfnO70456 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SfnO70456 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SfnO70456 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SfnO70456 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SfnO70456 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SfnO70456 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SfnO70456 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SfnO70456 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SfnO70456 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SfnO70456 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SfnO70456 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SfnO70456 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SfnO70456 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SfnO70456 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SfnO70456 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SfnO70456 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SfnO70456 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SfnO70456 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SfnO70456 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SfnO70456 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SfnO70456 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SfnO70456 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SfnO70456 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SfnO70456 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SfnO70456 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SfnO70456 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SfnO70456 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SfnO70456 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SfnO70456 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SfnO70456 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SfnO70456 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SfnO70456 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SfnO70456 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SfnO70456 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SfnO70456 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SfnO70456 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SfnO70456 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SfnO70456 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SfnO70456 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SfnO70456 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SfnO70456 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SfnO70456 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SfnO70456 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SfnO70456 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SfnO70456 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SfnO70456 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SfnO70456 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SfnO70456 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SfnO70456 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SfnO70456 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SfnO70456 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SfnO70456 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SfnO70456 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SfnO70456 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms