Protein–RNA interactions for Protein: O70435

Psma3, Proteasome subunit alpha type-3, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma3O70435 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psma3O70435 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psma3O70435 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psma3O70435 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Psma3O70435 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Psma3O70435 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Psma3O70435 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Psma3O70435 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Psma3O70435 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Psma3O70435 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Psma3O70435 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Psma3O70435 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Psma3O70435 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Psma3O70435 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Psma3O70435 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Psma3O70435 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Psma3O70435 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Psma3O70435 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Psma3O70435 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Psma3O70435 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Psma3O70435 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Psma3O70435 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Psma3O70435 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Psma3O70435 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Psma3O70435 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Psma3O70435 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Psma3O70435 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Psma3O70435 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Psma3O70435 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Psma3O70435 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Psma3O70435 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Psma3O70435 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Psma3O70435 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Psma3O70435 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Psma3O70435 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Psma3O70435 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Psma3O70435 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Psma3O70435 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Psma3O70435 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psma3O70435 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psma3O70435 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psma3O70435 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psma3O70435 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psma3O70435 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psma3O70435 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Psma3O70435 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Psma3O70435 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Psma3O70435 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Psma3O70435 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Psma3O70435 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Psma3O70435 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Psma3O70435 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Psma3O70435 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Psma3O70435 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Psma3O70435 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Psma3O70435 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Psma3O70435 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Psma3O70435 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psma3O70435 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psma3O70435 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psma3O70435 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psma3O70435 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psma3O70435 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psma3O70435 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psma3O70435 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psma3O70435 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psma3O70435 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psma3O70435 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psma3O70435 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psma3O70435 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psma3O70435 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psma3O70435 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psma3O70435 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Psma3O70435 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psma3O70435 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psma3O70435 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psma3O70435 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psma3O70435 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psma3O70435 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psma3O70435 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psma3O70435 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Psma3O70435 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psma3O70435 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psma3O70435 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Psma3O70435 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Psma3O70435 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Psma3O70435 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Psma3O70435 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Psma3O70435 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Psma3O70435 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psma3O70435 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psma3O70435 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psma3O70435 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psma3O70435 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psma3O70435 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psma3O70435 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psma3O70435 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psma3O70435 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psma3O70435 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psma3O70435 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms