Protein–RNA interactions for Protein: O70126

Aurkb, Aurora kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkbO70126 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
AurkbO70126 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
AurkbO70126 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AurkbO70126 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AurkbO70126 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AurkbO70126 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AurkbO70126 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AurkbO70126 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AurkbO70126 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AurkbO70126 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AurkbO70126 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AurkbO70126 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AurkbO70126 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AurkbO70126 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
AurkbO70126 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AurkbO70126 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AurkbO70126 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AurkbO70126 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AurkbO70126 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AurkbO70126 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AurkbO70126 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AurkbO70126 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AurkbO70126 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AurkbO70126 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AurkbO70126 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AurkbO70126 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AurkbO70126 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AurkbO70126 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AurkbO70126 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AurkbO70126 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AurkbO70126 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AurkbO70126 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AurkbO70126 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AurkbO70126 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AurkbO70126 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AurkbO70126 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AurkbO70126 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AurkbO70126 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AurkbO70126 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AurkbO70126 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AurkbO70126 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AurkbO70126 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AurkbO70126 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AurkbO70126 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AurkbO70126 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AurkbO70126 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AurkbO70126 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AurkbO70126 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AurkbO70126 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
AurkbO70126 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AurkbO70126 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AurkbO70126 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AurkbO70126 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AurkbO70126 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AurkbO70126 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AurkbO70126 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AurkbO70126 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AurkbO70126 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AurkbO70126 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AurkbO70126 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AurkbO70126 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AurkbO70126 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AurkbO70126 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AurkbO70126 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AurkbO70126 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AurkbO70126 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AurkbO70126 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AurkbO70126 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
AurkbO70126 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AurkbO70126 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AurkbO70126 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AurkbO70126 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AurkbO70126 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AurkbO70126 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AurkbO70126 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AurkbO70126 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AurkbO70126 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
AurkbO70126 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AurkbO70126 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AurkbO70126 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AurkbO70126 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AurkbO70126 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AurkbO70126 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AurkbO70126 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AurkbO70126 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AurkbO70126 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
AurkbO70126 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AurkbO70126 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AurkbO70126 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AurkbO70126 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
AurkbO70126 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AurkbO70126 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AurkbO70126 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AurkbO70126 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
AurkbO70126 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AurkbO70126 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AurkbO70126 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AurkbO70126 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
AurkbO70126 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AurkbO70126 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms