Protein–RNA interactions for Protein: O55241

Hcrt, Orexin, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HcrtO55241 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HcrtO55241 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HcrtO55241 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HcrtO55241 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HcrtO55241 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HcrtO55241 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HcrtO55241 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HcrtO55241 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HcrtO55241 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HcrtO55241 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HcrtO55241 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HcrtO55241 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HcrtO55241 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HcrtO55241 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HcrtO55241 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HcrtO55241 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HcrtO55241 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HcrtO55241 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HcrtO55241 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HcrtO55241 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HcrtO55241 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HcrtO55241 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HcrtO55241 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HcrtO55241 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HcrtO55241 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HcrtO55241 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HcrtO55241 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HcrtO55241 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HcrtO55241 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HcrtO55241 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HcrtO55241 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HcrtO55241 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HcrtO55241 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HcrtO55241 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HcrtO55241 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HcrtO55241 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HcrtO55241 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HcrtO55241 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HcrtO55241 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HcrtO55241 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HcrtO55241 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HcrtO55241 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HcrtO55241 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HcrtO55241 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HcrtO55241 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HcrtO55241 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HcrtO55241 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HcrtO55241 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HcrtO55241 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HcrtO55241 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HcrtO55241 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HcrtO55241 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HcrtO55241 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HcrtO55241 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HcrtO55241 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HcrtO55241 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HcrtO55241 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HcrtO55241 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HcrtO55241 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HcrtO55241 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HcrtO55241 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HcrtO55241 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HcrtO55241 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HcrtO55241 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HcrtO55241 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HcrtO55241 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HcrtO55241 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HcrtO55241 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HcrtO55241 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HcrtO55241 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HcrtO55241 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HcrtO55241 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HcrtO55241 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HcrtO55241 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HcrtO55241 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HcrtO55241 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HcrtO55241 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HcrtO55241 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HcrtO55241 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HcrtO55241 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HcrtO55241 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HcrtO55241 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HcrtO55241 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HcrtO55241 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HcrtO55241 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HcrtO55241 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HcrtO55241 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HcrtO55241 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HcrtO55241 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HcrtO55241 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HcrtO55241 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HcrtO55241 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HcrtO55241 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HcrtO55241 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HcrtO55241 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HcrtO55241 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HcrtO55241 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HcrtO55241 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HcrtO55241 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HcrtO55241 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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