Protein–RNA interactions for Protein: O55226

Chad, Chondroadherin, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChadO55226 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ChadO55226 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ChadO55226 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ChadO55226 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ChadO55226 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ChadO55226 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ChadO55226 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ChadO55226 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ChadO55226 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ChadO55226 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ChadO55226 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ChadO55226 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ChadO55226 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ChadO55226 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ChadO55226 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ChadO55226 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ChadO55226 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ChadO55226 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ChadO55226 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ChadO55226 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ChadO55226 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ChadO55226 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ChadO55226 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ChadO55226 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ChadO55226 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ChadO55226 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ChadO55226 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ChadO55226 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ChadO55226 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ChadO55226 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ChadO55226 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ChadO55226 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ChadO55226 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ChadO55226 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ChadO55226 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ChadO55226 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ChadO55226 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ChadO55226 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ChadO55226 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ChadO55226 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChadO55226 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChadO55226 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChadO55226 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChadO55226 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChadO55226 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChadO55226 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChadO55226 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ChadO55226 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ChadO55226 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ChadO55226 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ChadO55226 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ChadO55226 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ChadO55226 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ChadO55226 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ChadO55226 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ChadO55226 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ChadO55226 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ChadO55226 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ChadO55226 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ChadO55226 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ChadO55226 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ChadO55226 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ChadO55226 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ChadO55226 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ChadO55226 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ChadO55226 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ChadO55226 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ChadO55226 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ChadO55226 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ChadO55226 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ChadO55226 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ChadO55226 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ChadO55226 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ChadO55226 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ChadO55226 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ChadO55226 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ChadO55226 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ChadO55226 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ChadO55226 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ChadO55226 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ChadO55226 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ChadO55226 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChadO55226 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChadO55226 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChadO55226 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChadO55226 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChadO55226 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChadO55226 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChadO55226 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChadO55226 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChadO55226 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChadO55226 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChadO55226 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ChadO55226 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ChadO55226 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ChadO55226 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ChadO55226 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ChadO55226 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ChadO55226 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ChadO55226 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms