Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nipsnap2O55126 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nipsnap2O55126 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nipsnap2O55126 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nipsnap2O55126 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nipsnap2O55126 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nipsnap2O55126 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nipsnap2O55126 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nipsnap2O55126 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nipsnap2O55126 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nipsnap2O55126 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nipsnap2O55126 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nipsnap2O55126 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nipsnap2O55126 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nipsnap2O55126 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nipsnap2O55126 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nipsnap2O55126 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Nipsnap2O55126 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nipsnap2O55126 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nipsnap2O55126 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nipsnap2O55126 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nipsnap2O55126 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nipsnap2O55126 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nipsnap2O55126 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nipsnap2O55126 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nipsnap2O55126 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nipsnap2O55126 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nipsnap2O55126 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nipsnap2O55126 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nipsnap2O55126 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nipsnap2O55126 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Nipsnap2O55126 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nipsnap2O55126 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nipsnap2O55126 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nipsnap2O55126 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nipsnap2O55126 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nipsnap2O55126 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nipsnap2O55126 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nipsnap2O55126 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nipsnap2O55126 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nipsnap2O55126 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Nipsnap2O55126 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nipsnap2O55126 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nipsnap2O55126 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nipsnap2O55126 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Nipsnap2O55126 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nipsnap2O55126 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nipsnap2O55126 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nipsnap2O55126 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nipsnap2O55126 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nipsnap2O55126 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nipsnap2O55126 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nipsnap2O55126 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nipsnap2O55126 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nipsnap2O55126 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nipsnap2O55126 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nipsnap2O55126 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nipsnap2O55126 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nipsnap2O55126 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nipsnap2O55126 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nipsnap2O55126 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nipsnap2O55126 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nipsnap2O55126 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nipsnap2O55126 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nipsnap2O55126 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nipsnap2O55126 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nipsnap2O55126 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nipsnap2O55126 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nipsnap2O55126 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nipsnap2O55126 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nipsnap2O55126 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nipsnap2O55126 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nipsnap2O55126 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nipsnap2O55126 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nipsnap2O55126 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nipsnap2O55126 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nipsnap2O55126 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nipsnap2O55126 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nipsnap2O55126 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nipsnap2O55126 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nipsnap2O55126 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Nipsnap2O55126 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nipsnap2O55126 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nipsnap2O55126 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nipsnap2O55126 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nipsnap2O55126 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nipsnap2O55126 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nipsnap2O55126 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nipsnap2O55126 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nipsnap2O55126 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nipsnap2O55126 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nipsnap2O55126 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nipsnap2O55126 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nipsnap2O55126 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nipsnap2O55126 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nipsnap2O55126 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nipsnap2O55126 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nipsnap2O55126 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nipsnap2O55126 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nipsnap2O55126 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms