Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PrxO55103 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PrxO55103 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PrxO55103 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PrxO55103 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PrxO55103 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PrxO55103 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PrxO55103 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PrxO55103 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PrxO55103 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PrxO55103 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PrxO55103 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PrxO55103 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PrxO55103 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PrxO55103 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PrxO55103 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PrxO55103 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PrxO55103 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PrxO55103 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PrxO55103 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
PrxO55103 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PrxO55103 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PrxO55103 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PrxO55103 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PrxO55103 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PrxO55103 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PrxO55103 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PrxO55103 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PrxO55103 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PrxO55103 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PrxO55103 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PrxO55103 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PrxO55103 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PrxO55103 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PrxO55103 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PrxO55103 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PrxO55103 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PrxO55103 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PrxO55103 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PrxO55103 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PrxO55103 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PrxO55103 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PrxO55103 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PrxO55103 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PrxO55103 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PrxO55103 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PrxO55103 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PrxO55103 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PrxO55103 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PrxO55103 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PrxO55103 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PrxO55103 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PrxO55103 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PrxO55103 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PrxO55103 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PrxO55103 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PrxO55103 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PrxO55103 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
PrxO55103 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.29
PrxO55103 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PrxO55103 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PrxO55103 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
PrxO55103 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PrxO55103 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PrxO55103 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PrxO55103 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PrxO55103 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PrxO55103 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PrxO55103 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PrxO55103 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PrxO55103 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PrxO55103 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PrxO55103 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PrxO55103 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PrxO55103 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PrxO55103 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PrxO55103 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PrxO55103 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PrxO55103 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PrxO55103 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PrxO55103 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PrxO55103 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PrxO55103 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PrxO55103 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PrxO55103 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PrxO55103 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PrxO55103 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PrxO55103 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PrxO55103 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PrxO55103 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
PrxO55103 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PrxO55103 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PrxO55103 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PrxO55103 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PrxO55103 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PrxO55103 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PrxO55103 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PrxO55103 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PrxO55103 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PrxO55103 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms