Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trappc3O55013 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc3O55013 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc3O55013 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc3O55013 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc3O55013 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc3O55013 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc3O55013 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc3O55013 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trappc3O55013 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trappc3O55013 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trappc3O55013 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trappc3O55013 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Trappc3O55013 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Trappc3O55013 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trappc3O55013 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trappc3O55013 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trappc3O55013 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Trappc3O55013 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trappc3O55013 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trappc3O55013 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trappc3O55013 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trappc3O55013 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trappc3O55013 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trappc3O55013 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc3O55013 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc3O55013 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc3O55013 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc3O55013 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc3O55013 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc3O55013 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc3O55013 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc3O55013 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc3O55013 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc3O55013 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trappc3O55013 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trappc3O55013 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trappc3O55013 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trappc3O55013 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trappc3O55013 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trappc3O55013 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trappc3O55013 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trappc3O55013 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trappc3O55013 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trappc3O55013 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trappc3O55013 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trappc3O55013 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trappc3O55013 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trappc3O55013 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Trappc3O55013 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trappc3O55013 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trappc3O55013 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trappc3O55013 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trappc3O55013 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trappc3O55013 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trappc3O55013 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trappc3O55013 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trappc3O55013 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trappc3O55013 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trappc3O55013 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trappc3O55013 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trappc3O55013 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trappc3O55013 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trappc3O55013 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc3O55013 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc3O55013 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc3O55013 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc3O55013 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trappc3O55013 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trappc3O55013 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc3O55013 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc3O55013 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc3O55013 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc3O55013 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc3O55013 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc3O55013 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc3O55013 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc3O55013 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc3O55013 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc3O55013 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trappc3O55013 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trappc3O55013 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trappc3O55013 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trappc3O55013 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trappc3O55013 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trappc3O55013 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trappc3O55013 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trappc3O55013 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trappc3O55013 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trappc3O55013 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trappc3O55013 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc3O55013 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc3O55013 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc3O55013 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc3O55013 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trappc3O55013 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trappc3O55013 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trappc3O55013 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trappc3O55013 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trappc3O55013 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms