Protein–RNA interactions for Protein: O54946

Dnajb6, DnaJ homolog subfamily B member 6, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb6O54946 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dnajb6O54946 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Dnajb6O54946 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Dnajb6O54946 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dnajb6O54946 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Dnajb6O54946 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dnajb6O54946 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dnajb6O54946 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dnajb6O54946 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dnajb6O54946 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dnajb6O54946 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dnajb6O54946 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dnajb6O54946 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dnajb6O54946 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dnajb6O54946 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dnajb6O54946 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dnajb6O54946 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dnajb6O54946 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dnajb6O54946 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dnajb6O54946 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dnajb6O54946 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dnajb6O54946 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dnajb6O54946 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dnajb6O54946 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dnajb6O54946 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dnajb6O54946 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Dnajb6O54946 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dnajb6O54946 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dnajb6O54946 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dnajb6O54946 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dnajb6O54946 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dnajb6O54946 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dnajb6O54946 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dnajb6O54946 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dnajb6O54946 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dnajb6O54946 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dnajb6O54946 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Dnajb6O54946 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dnajb6O54946 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dnajb6O54946 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dnajb6O54946 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dnajb6O54946 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dnajb6O54946 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dnajb6O54946 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dnajb6O54946 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dnajb6O54946 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dnajb6O54946 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dnajb6O54946 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dnajb6O54946 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dnajb6O54946 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dnajb6O54946 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dnajb6O54946 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dnajb6O54946 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dnajb6O54946 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dnajb6O54946 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dnajb6O54946 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dnajb6O54946 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Dnajb6O54946 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dnajb6O54946 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dnajb6O54946 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dnajb6O54946 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dnajb6O54946 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dnajb6O54946 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dnajb6O54946 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dnajb6O54946 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dnajb6O54946 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dnajb6O54946 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dnajb6O54946 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dnajb6O54946 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dnajb6O54946 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dnajb6O54946 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dnajb6O54946 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Dnajb6O54946 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Dnajb6O54946 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dnajb6O54946 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dnajb6O54946 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dnajb6O54946 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dnajb6O54946 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dnajb6O54946 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dnajb6O54946 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Dnajb6O54946 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dnajb6O54946 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dnajb6O54946 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dnajb6O54946 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dnajb6O54946 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dnajb6O54946 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dnajb6O54946 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dnajb6O54946 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dnajb6O54946 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dnajb6O54946 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Dnajb6O54946 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dnajb6O54946 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dnajb6O54946 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dnajb6O54946 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dnajb6O54946 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dnajb6O54946 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dnajb6O54946 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dnajb6O54946 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Dnajb6O54946 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Dnajb6O54946 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms