Protein–RNA interactions for Protein: O54910

Nfkbie, NF-kappa-B inhibitor epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbieO54910 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NfkbieO54910 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NfkbieO54910 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NfkbieO54910 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NfkbieO54910 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NfkbieO54910 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NfkbieO54910 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NfkbieO54910 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NfkbieO54910 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NfkbieO54910 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NfkbieO54910 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NfkbieO54910 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NfkbieO54910 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NfkbieO54910 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NfkbieO54910 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NfkbieO54910 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NfkbieO54910 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NfkbieO54910 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NfkbieO54910 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NfkbieO54910 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NfkbieO54910 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NfkbieO54910 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NfkbieO54910 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NfkbieO54910 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NfkbieO54910 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NfkbieO54910 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NfkbieO54910 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NfkbieO54910 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NfkbieO54910 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NfkbieO54910 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NfkbieO54910 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NfkbieO54910 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NfkbieO54910 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NfkbieO54910 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NfkbieO54910 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
NfkbieO54910 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NfkbieO54910 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NfkbieO54910 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NfkbieO54910 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NfkbieO54910 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NfkbieO54910 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NfkbieO54910 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NfkbieO54910 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NfkbieO54910 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NfkbieO54910 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NfkbieO54910 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NfkbieO54910 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NfkbieO54910 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NfkbieO54910 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NfkbieO54910 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NfkbieO54910 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NfkbieO54910 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NfkbieO54910 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NfkbieO54910 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NfkbieO54910 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NfkbieO54910 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NfkbieO54910 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NfkbieO54910 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NfkbieO54910 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NfkbieO54910 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NfkbieO54910 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NfkbieO54910 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NfkbieO54910 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NfkbieO54910 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NfkbieO54910 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NfkbieO54910 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NfkbieO54910 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NfkbieO54910 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NfkbieO54910 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NfkbieO54910 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NfkbieO54910 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NfkbieO54910 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NfkbieO54910 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NfkbieO54910 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NfkbieO54910 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NfkbieO54910 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NfkbieO54910 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NfkbieO54910 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NfkbieO54910 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NfkbieO54910 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NfkbieO54910 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NfkbieO54910 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NfkbieO54910 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NfkbieO54910 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NfkbieO54910 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NfkbieO54910 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NfkbieO54910 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NfkbieO54910 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NfkbieO54910 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NfkbieO54910 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NfkbieO54910 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NfkbieO54910 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NfkbieO54910 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NfkbieO54910 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NfkbieO54910 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NfkbieO54910 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NfkbieO54910 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NfkbieO54910 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NfkbieO54910 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NfkbieO54910 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms