Protein–RNA interactions for Protein: O54799

Nmbr, Neuromedin-B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbrO54799 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NmbrO54799 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NmbrO54799 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
NmbrO54799 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NmbrO54799 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NmbrO54799 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NmbrO54799 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NmbrO54799 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NmbrO54799 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NmbrO54799 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NmbrO54799 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NmbrO54799 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NmbrO54799 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NmbrO54799 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NmbrO54799 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NmbrO54799 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NmbrO54799 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NmbrO54799 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NmbrO54799 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NmbrO54799 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NmbrO54799 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NmbrO54799 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NmbrO54799 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NmbrO54799 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NmbrO54799 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NmbrO54799 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NmbrO54799 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NmbrO54799 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NmbrO54799 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NmbrO54799 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NmbrO54799 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NmbrO54799 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NmbrO54799 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NmbrO54799 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NmbrO54799 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NmbrO54799 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NmbrO54799 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NmbrO54799 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NmbrO54799 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NmbrO54799 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NmbrO54799 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NmbrO54799 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NmbrO54799 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NmbrO54799 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NmbrO54799 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NmbrO54799 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NmbrO54799 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NmbrO54799 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NmbrO54799 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NmbrO54799 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NmbrO54799 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NmbrO54799 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NmbrO54799 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NmbrO54799 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NmbrO54799 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NmbrO54799 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NmbrO54799 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NmbrO54799 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NmbrO54799 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NmbrO54799 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NmbrO54799 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NmbrO54799 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NmbrO54799 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NmbrO54799 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NmbrO54799 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NmbrO54799 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NmbrO54799 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NmbrO54799 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NmbrO54799 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NmbrO54799 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NmbrO54799 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NmbrO54799 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NmbrO54799 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NmbrO54799 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NmbrO54799 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NmbrO54799 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NmbrO54799 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NmbrO54799 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NmbrO54799 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NmbrO54799 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NmbrO54799 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NmbrO54799 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NmbrO54799 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NmbrO54799 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NmbrO54799 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NmbrO54799 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NmbrO54799 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NmbrO54799 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NmbrO54799 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NmbrO54799 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NmbrO54799 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NmbrO54799 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NmbrO54799 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NmbrO54799 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NmbrO54799 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NmbrO54799 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NmbrO54799 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NmbrO54799 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NmbrO54799 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NmbrO54799 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms