Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Limk2O54785 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Limk2O54785 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Limk2O54785 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Limk2O54785 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Limk2O54785 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Limk2O54785 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Limk2O54785 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Limk2O54785 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Limk2O54785 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Limk2O54785 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Limk2O54785 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Limk2O54785 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Limk2O54785 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Limk2O54785 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Limk2O54785 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Limk2O54785 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Limk2O54785 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Limk2O54785 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Limk2O54785 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Limk2O54785 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Limk2O54785 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Limk2O54785 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Limk2O54785 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Limk2O54785 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Limk2O54785 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Limk2O54785 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Limk2O54785 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Limk2O54785 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Limk2O54785 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Limk2O54785 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Limk2O54785 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Limk2O54785 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Limk2O54785 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Limk2O54785 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Limk2O54785 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Limk2O54785 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Limk2O54785 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Limk2O54785 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Limk2O54785 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Limk2O54785 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Limk2O54785 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Limk2O54785 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Limk2O54785 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Limk2O54785 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Limk2O54785 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Limk2O54785 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Limk2O54785 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Limk2O54785 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Limk2O54785 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Limk2O54785 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Limk2O54785 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Limk2O54785 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Limk2O54785 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Limk2O54785 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Limk2O54785 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Limk2O54785 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Limk2O54785 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Limk2O54785 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Limk2O54785 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Limk2O54785 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Limk2O54785 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Limk2O54785 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Limk2O54785 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Limk2O54785 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Limk2O54785 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Limk2O54785 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Limk2O54785 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Limk2O54785 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Limk2O54785 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Limk2O54785 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Limk2O54785 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Limk2O54785 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Limk2O54785 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Limk2O54785 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Limk2O54785 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Limk2O54785 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Limk2O54785 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Limk2O54785 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Limk2O54785 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Limk2O54785 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Limk2O54785 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Limk2O54785 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Limk2O54785 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Limk2O54785 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Limk2O54785 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Limk2O54785 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Limk2O54785 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Limk2O54785 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Limk2O54785 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Limk2O54785 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Limk2O54785 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Limk2O54785 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Limk2O54785 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Limk2O54785 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Limk2O54785 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Limk2O54785 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Limk2O54785 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Limk2O54785 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Limk2O54785 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms