Protein–RNA interactions for Protein: O54709

Klrk1, NKG2-D type II integral membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klrk1O54709 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Klrk1O54709 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Klrk1O54709 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Klrk1O54709 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Klrk1O54709 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Klrk1O54709 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Klrk1O54709 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Klrk1O54709 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Klrk1O54709 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Klrk1O54709 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Klrk1O54709 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Klrk1O54709 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Klrk1O54709 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Klrk1O54709 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Klrk1O54709 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Klrk1O54709 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Klrk1O54709 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Klrk1O54709 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Klrk1O54709 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Klrk1O54709 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Klrk1O54709 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Klrk1O54709 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Klrk1O54709 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Klrk1O54709 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Klrk1O54709 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Klrk1O54709 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Klrk1O54709 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Klrk1O54709 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Klrk1O54709 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Klrk1O54709 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Klrk1O54709 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Klrk1O54709 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Klrk1O54709 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Klrk1O54709 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Klrk1O54709 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Klrk1O54709 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Klrk1O54709 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Klrk1O54709 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Klrk1O54709 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Klrk1O54709 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Klrk1O54709 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Klrk1O54709 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Klrk1O54709 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Klrk1O54709 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Klrk1O54709 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Klrk1O54709 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Klrk1O54709 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Klrk1O54709 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Klrk1O54709 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Klrk1O54709 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Klrk1O54709 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Klrk1O54709 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Klrk1O54709 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Klrk1O54709 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Klrk1O54709 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Klrk1O54709 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Klrk1O54709 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Klrk1O54709 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Klrk1O54709 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Klrk1O54709 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Klrk1O54709 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Klrk1O54709 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Klrk1O54709 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Klrk1O54709 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Klrk1O54709 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Klrk1O54709 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Klrk1O54709 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Klrk1O54709 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Klrk1O54709 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Klrk1O54709 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Klrk1O54709 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Klrk1O54709 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Klrk1O54709 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Klrk1O54709 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Klrk1O54709 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Klrk1O54709 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Klrk1O54709 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Klrk1O54709 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Klrk1O54709 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Klrk1O54709 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Klrk1O54709 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Klrk1O54709 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Klrk1O54709 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Klrk1O54709 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Klrk1O54709 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Klrk1O54709 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Klrk1O54709 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Klrk1O54709 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Klrk1O54709 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Klrk1O54709 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Klrk1O54709 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Klrk1O54709 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Klrk1O54709 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Klrk1O54709 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Klrk1O54709 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Klrk1O54709 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Klrk1O54709 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Klrk1O54709 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Klrk1O54709 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Klrk1O54709 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms