Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FxnO35943 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FxnO35943 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FxnO35943 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FxnO35943 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FxnO35943 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FxnO35943 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FxnO35943 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FxnO35943 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FxnO35943 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FxnO35943 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FxnO35943 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FxnO35943 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FxnO35943 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FxnO35943 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FxnO35943 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FxnO35943 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FxnO35943 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FxnO35943 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FxnO35943 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FxnO35943 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FxnO35943 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FxnO35943 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FxnO35943 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FxnO35943 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FxnO35943 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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FxnO35943 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FxnO35943 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FxnO35943 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FxnO35943 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FxnO35943 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FxnO35943 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FxnO35943 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FxnO35943 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FxnO35943 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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FxnO35943 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FxnO35943 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FxnO35943 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FxnO35943 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FxnO35943 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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FxnO35943 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FxnO35943 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FxnO35943 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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FxnO35943 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FxnO35943 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FxnO35943 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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FxnO35943 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FxnO35943 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FxnO35943 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FxnO35943 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FxnO35943 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FxnO35943 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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FxnO35943 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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FxnO35943 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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FxnO35943 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FxnO35943 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FxnO35943 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FxnO35943 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FxnO35943 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FxnO35943 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FxnO35943 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FxnO35943 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
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FxnO35943 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FxnO35943 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FxnO35943 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FxnO35943 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FxnO35943 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FxnO35943 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FxnO35943 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FxnO35943 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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