Protein–RNA interactions for Protein: O35926

Cdk5r2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r2O35926 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk5r2O35926 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk5r2O35926 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk5r2O35926 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdk5r2O35926 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdk5r2O35926 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdk5r2O35926 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdk5r2O35926 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdk5r2O35926 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdk5r2O35926 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdk5r2O35926 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdk5r2O35926 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdk5r2O35926 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdk5r2O35926 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdk5r2O35926 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdk5r2O35926 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdk5r2O35926 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdk5r2O35926 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdk5r2O35926 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdk5r2O35926 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdk5r2O35926 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdk5r2O35926 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdk5r2O35926 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdk5r2O35926 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdk5r2O35926 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdk5r2O35926 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdk5r2O35926 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdk5r2O35926 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdk5r2O35926 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdk5r2O35926 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdk5r2O35926 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdk5r2O35926 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdk5r2O35926 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdk5r2O35926 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdk5r2O35926 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdk5r2O35926 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdk5r2O35926 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdk5r2O35926 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdk5r2O35926 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdk5r2O35926 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdk5r2O35926 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdk5r2O35926 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdk5r2O35926 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdk5r2O35926 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdk5r2O35926 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdk5r2O35926 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdk5r2O35926 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdk5r2O35926 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdk5r2O35926 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdk5r2O35926 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdk5r2O35926 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdk5r2O35926 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdk5r2O35926 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdk5r2O35926 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdk5r2O35926 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdk5r2O35926 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdk5r2O35926 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdk5r2O35926 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdk5r2O35926 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdk5r2O35926 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdk5r2O35926 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdk5r2O35926 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdk5r2O35926 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdk5r2O35926 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdk5r2O35926 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdk5r2O35926 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdk5r2O35926 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdk5r2O35926 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdk5r2O35926 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdk5r2O35926 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdk5r2O35926 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdk5r2O35926 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdk5r2O35926 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdk5r2O35926 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdk5r2O35926 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdk5r2O35926 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdk5r2O35926 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdk5r2O35926 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdk5r2O35926 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdk5r2O35926 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdk5r2O35926 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdk5r2O35926 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdk5r2O35926 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdk5r2O35926 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdk5r2O35926 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdk5r2O35926 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdk5r2O35926 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cdk5r2O35926 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cdk5r2O35926 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cdk5r2O35926 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdk5r2O35926 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdk5r2O35926 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdk5r2O35926 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdk5r2O35926 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdk5r2O35926 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdk5r2O35926 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdk5r2O35926 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdk5r2O35926 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdk5r2O35926 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdk5r2O35926 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms