Protein–RNA interactions for Protein: O35906

Spib, Transcription factor Spi-B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpibO35906 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SpibO35906 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SpibO35906 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SpibO35906 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SpibO35906 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SpibO35906 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SpibO35906 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SpibO35906 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SpibO35906 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SpibO35906 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SpibO35906 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SpibO35906 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SpibO35906 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SpibO35906 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SpibO35906 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SpibO35906 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SpibO35906 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SpibO35906 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SpibO35906 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SpibO35906 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SpibO35906 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SpibO35906 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SpibO35906 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SpibO35906 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SpibO35906 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SpibO35906 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SpibO35906 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SpibO35906 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SpibO35906 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SpibO35906 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SpibO35906 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SpibO35906 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SpibO35906 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SpibO35906 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SpibO35906 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SpibO35906 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SpibO35906 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SpibO35906 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SpibO35906 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SpibO35906 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SpibO35906 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SpibO35906 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SpibO35906 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SpibO35906 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SpibO35906 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SpibO35906 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SpibO35906 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SpibO35906 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SpibO35906 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SpibO35906 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SpibO35906 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SpibO35906 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SpibO35906 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SpibO35906 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SpibO35906 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SpibO35906 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SpibO35906 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SpibO35906 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SpibO35906 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SpibO35906 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SpibO35906 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SpibO35906 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SpibO35906 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SpibO35906 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SpibO35906 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SpibO35906 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SpibO35906 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SpibO35906 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SpibO35906 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SpibO35906 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SpibO35906 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SpibO35906 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SpibO35906 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SpibO35906 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SpibO35906 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SpibO35906 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SpibO35906 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SpibO35906 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SpibO35906 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SpibO35906 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SpibO35906 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SpibO35906 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SpibO35906 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SpibO35906 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SpibO35906 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SpibO35906 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SpibO35906 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SpibO35906 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SpibO35906 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SpibO35906 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SpibO35906 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SpibO35906 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SpibO35906 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SpibO35906 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SpibO35906 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SpibO35906 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SpibO35906 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SpibO35906 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SpibO35906 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SpibO35906 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms