Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ppfibp2O35711 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Ppfibp2O35711 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ppfibp2O35711 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ppfibp2O35711 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Ppfibp2O35711 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ppfibp2O35711 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ppfibp2O35711 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ppfibp2O35711 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Ppfibp2O35711 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ppfibp2O35711 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ppfibp2O35711 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ppfibp2O35711 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ppfibp2O35711 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ppfibp2O35711 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ppfibp2O35711 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ppfibp2O35711 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ppfibp2O35711 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ppfibp2O35711 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ppfibp2O35711 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ppfibp2O35711 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ppfibp2O35711 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ppfibp2O35711 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ppfibp2O35711 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Ppfibp2O35711 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ppfibp2O35711 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ppfibp2O35711 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Ppfibp2O35711 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ppfibp2O35711 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ppfibp2O35711 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ppfibp2O35711 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ppfibp2O35711 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ppfibp2O35711 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ppfibp2O35711 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ppfibp2O35711 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ppfibp2O35711 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ppfibp2O35711 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ppfibp2O35711 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ppfibp2O35711 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ppfibp2O35711 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ppfibp2O35711 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ppfibp2O35711 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ppfibp2O35711 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ppfibp2O35711 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ppfibp2O35711 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ppfibp2O35711 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ppfibp2O35711 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ppfibp2O35711 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ppfibp2O35711 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ppfibp2O35711 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ppfibp2O35711 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ppfibp2O35711 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ppfibp2O35711 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Ppfibp2O35711 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ppfibp2O35711 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Ppfibp2O35711 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ppfibp2O35711 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ppfibp2O35711 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ppfibp2O35711 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ppfibp2O35711 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ppfibp2O35711 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ppfibp2O35711 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ppfibp2O35711 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Ppfibp2O35711 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ppfibp2O35711 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ppfibp2O35711 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ppfibp2O35711 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ppfibp2O35711 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ppfibp2O35711 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ppfibp2O35711 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ppfibp2O35711 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ppfibp2O35711 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ppfibp2O35711 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ppfibp2O35711 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Ppfibp2O35711 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ppfibp2O35711 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ppfibp2O35711 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ppfibp2O35711 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ppfibp2O35711 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ppfibp2O35711 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ppfibp2O35711 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ppfibp2O35711 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ppfibp2O35711 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ppfibp2O35711 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ppfibp2O35711 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ppfibp2O35711 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ppfibp2O35711 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ppfibp2O35711 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ppfibp2O35711 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ppfibp2O35711 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ppfibp2O35711 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ppfibp2O35711 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Ppfibp2O35711 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ppfibp2O35711 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ppfibp2O35711 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ppfibp2O35711 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ppfibp2O35711 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ppfibp2O35711 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ppfibp2O35711 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Ppfibp2O35711 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms