Protein–RNA interactions for Protein: O35551

Rabep1, Rab GTPase-binding effector protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabep1O35551 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rabep1O35551 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rabep1O35551 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rabep1O35551 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rabep1O35551 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rabep1O35551 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rabep1O35551 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rabep1O35551 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rabep1O35551 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
Rabep1O35551 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rabep1O35551 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rabep1O35551 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Rabep1O35551 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Rabep1O35551 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rabep1O35551 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rabep1O35551 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rabep1O35551 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rabep1O35551 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rabep1O35551 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rabep1O35551 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rabep1O35551 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rabep1O35551 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rabep1O35551 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rabep1O35551 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rabep1O35551 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rabep1O35551 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rabep1O35551 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rabep1O35551 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rabep1O35551 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rabep1O35551 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rabep1O35551 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rabep1O35551 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rabep1O35551 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rabep1O35551 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rabep1O35551 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rabep1O35551 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rabep1O35551 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rabep1O35551 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rabep1O35551 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rabep1O35551 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rabep1O35551 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rabep1O35551 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rabep1O35551 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rabep1O35551 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rabep1O35551 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rabep1O35551 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rabep1O35551 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rabep1O35551 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rabep1O35551 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rabep1O35551 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rabep1O35551 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rabep1O35551 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rabep1O35551 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rabep1O35551 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Rabep1O35551 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Rabep1O35551 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Rabep1O35551 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rabep1O35551 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rabep1O35551 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rabep1O35551 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rabep1O35551 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rabep1O35551 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rabep1O35551 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rabep1O35551 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rabep1O35551 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rabep1O35551 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rabep1O35551 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rabep1O35551 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rabep1O35551 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Rabep1O35551 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rabep1O35551 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rabep1O35551 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rabep1O35551 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rabep1O35551 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rabep1O35551 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rabep1O35551 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rabep1O35551 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rabep1O35551 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rabep1O35551 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rabep1O35551 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rabep1O35551 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rabep1O35551 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rabep1O35551 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rabep1O35551 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rabep1O35551 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rabep1O35551 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rabep1O35551 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rabep1O35551 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rabep1O35551 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rabep1O35551 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rabep1O35551 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rabep1O35551 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rabep1O35551 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rabep1O35551 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rabep1O35551 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rabep1O35551 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rabep1O35551 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rabep1O35551 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rabep1O35551 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rabep1O35551 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms