Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Abcc1O35379 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Abcc1O35379 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Abcc1O35379 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Abcc1O35379 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Abcc1O35379 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Abcc1O35379 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Abcc1O35379 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Abcc1O35379 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Abcc1O35379 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Abcc1O35379 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Abcc1O35379 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Abcc1O35379 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Abcc1O35379 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Abcc1O35379 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Abcc1O35379 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Abcc1O35379 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Abcc1O35379 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Abcc1O35379 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Abcc1O35379 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Abcc1O35379 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Abcc1O35379 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Abcc1O35379 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Abcc1O35379 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Abcc1O35379 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Abcc1O35379 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
Abcc1O35379 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Abcc1O35379 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Abcc1O35379 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Abcc1O35379 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Abcc1O35379 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Abcc1O35379 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Abcc1O35379 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Abcc1O35379 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Abcc1O35379 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Abcc1O35379 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Abcc1O35379 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Abcc1O35379 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Abcc1O35379 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Abcc1O35379 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Abcc1O35379 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Abcc1O35379 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Abcc1O35379 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Abcc1O35379 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Abcc1O35379 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Abcc1O35379 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Abcc1O35379 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Abcc1O35379 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Abcc1O35379 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Abcc1O35379 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Abcc1O35379 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Abcc1O35379 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Abcc1O35379 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Abcc1O35379 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Abcc1O35379 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Abcc1O35379 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Abcc1O35379 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Abcc1O35379 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Abcc1O35379 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Abcc1O35379 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Abcc1O35379 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Abcc1O35379 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Abcc1O35379 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Abcc1O35379 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Abcc1O35379 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Abcc1O35379 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Abcc1O35379 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Abcc1O35379 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Abcc1O35379 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Abcc1O35379 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Abcc1O35379 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Abcc1O35379 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Abcc1O35379 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Abcc1O35379 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Abcc1O35379 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Abcc1O35379 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Abcc1O35379 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Abcc1O35379 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Abcc1O35379 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Abcc1O35379 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Abcc1O35379 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Abcc1O35379 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Abcc1O35379 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Abcc1O35379 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Abcc1O35379 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Abcc1O35379 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Abcc1O35379 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Abcc1O35379 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Abcc1O35379 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Abcc1O35379 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Abcc1O35379 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Abcc1O35379 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Abcc1O35379 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Abcc1O35379 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Abcc1O35379 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Abcc1O35379 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Abcc1O35379 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Abcc1O35379 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Abcc1O35379 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Abcc1O35379 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms