Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kpna3O35344 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kpna3O35344 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kpna3O35344 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kpna3O35344 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kpna3O35344 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kpna3O35344 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kpna3O35344 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kpna3O35344 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kpna3O35344 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kpna3O35344 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kpna3O35344 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kpna3O35344 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kpna3O35344 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kpna3O35344 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kpna3O35344 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kpna3O35344 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kpna3O35344 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kpna3O35344 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kpna3O35344 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kpna3O35344 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kpna3O35344 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kpna3O35344 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Kpna3O35344 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kpna3O35344 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kpna3O35344 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kpna3O35344 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kpna3O35344 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kpna3O35344 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kpna3O35344 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kpna3O35344 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kpna3O35344 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kpna3O35344 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kpna3O35344 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kpna3O35344 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kpna3O35344 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kpna3O35344 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kpna3O35344 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kpna3O35344 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kpna3O35344 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kpna3O35344 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kpna3O35344 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kpna3O35344 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kpna3O35344 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kpna3O35344 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kpna3O35344 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kpna3O35344 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kpna3O35344 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kpna3O35344 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kpna3O35344 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kpna3O35344 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kpna3O35344 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kpna3O35344 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kpna3O35344 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kpna3O35344 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kpna3O35344 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kpna3O35344 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kpna3O35344 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kpna3O35344 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kpna3O35344 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kpna3O35344 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kpna3O35344 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kpna3O35344 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kpna3O35344 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kpna3O35344 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kpna3O35344 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kpna3O35344 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kpna3O35344 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kpna3O35344 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kpna3O35344 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kpna3O35344 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kpna3O35344 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kpna3O35344 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kpna3O35344 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kpna3O35344 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kpna3O35344 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kpna3O35344 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kpna3O35344 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kpna3O35344 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kpna3O35344 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kpna3O35344 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kpna3O35344 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kpna3O35344 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kpna3O35344 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kpna3O35344 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Kpna3O35344 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kpna3O35344 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kpna3O35344 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kpna3O35344 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kpna3O35344 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kpna3O35344 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kpna3O35344 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kpna3O35344 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kpna3O35344 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kpna3O35344 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kpna3O35344 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kpna3O35344 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Kpna3O35344 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kpna3O35344 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kpna3O35344 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms