Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Smad6O35182 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smad6O35182 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smad6O35182 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smad6O35182 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smad6O35182 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smad6O35182 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smad6O35182 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smad6O35182 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smad6O35182 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smad6O35182 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smad6O35182 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smad6O35182 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smad6O35182 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smad6O35182 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smad6O35182 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smad6O35182 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smad6O35182 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smad6O35182 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smad6O35182 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smad6O35182 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smad6O35182 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smad6O35182 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smad6O35182 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smad6O35182 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smad6O35182 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smad6O35182 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smad6O35182 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smad6O35182 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Smad6O35182 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smad6O35182 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smad6O35182 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Smad6O35182 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smad6O35182 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smad6O35182 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smad6O35182 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smad6O35182 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smad6O35182 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smad6O35182 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Smad6O35182 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smad6O35182 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smad6O35182 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smad6O35182 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smad6O35182 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smad6O35182 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Smad6O35182 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smad6O35182 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Smad6O35182 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smad6O35182 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smad6O35182 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smad6O35182 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smad6O35182 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smad6O35182 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smad6O35182 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smad6O35182 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smad6O35182 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smad6O35182 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smad6O35182 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smad6O35182 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smad6O35182 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smad6O35182 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smad6O35182 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smad6O35182 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smad6O35182 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smad6O35182 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smad6O35182 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smad6O35182 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Smad6O35182 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smad6O35182 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smad6O35182 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smad6O35182 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smad6O35182 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smad6O35182 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smad6O35182 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smad6O35182 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smad6O35182 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smad6O35182 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smad6O35182 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smad6O35182 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smad6O35182 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smad6O35182 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smad6O35182 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smad6O35182 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smad6O35182 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smad6O35182 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smad6O35182 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smad6O35182 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smad6O35182 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smad6O35182 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smad6O35182 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smad6O35182 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smad6O35182 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Smad6O35182 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smad6O35182 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smad6O35182 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smad6O35182 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smad6O35182 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smad6O35182 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smad6O35182 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smad6O35182 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms