Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Polr1aO35134 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Polr1aO35134 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Polr1aO35134 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Polr1aO35134 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Polr1aO35134 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Polr1aO35134 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Polr1aO35134 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Polr1aO35134 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Polr1aO35134 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Polr1aO35134 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Polr1aO35134 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Polr1aO35134 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Polr1aO35134 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Polr1aO35134 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Polr1aO35134 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Polr1aO35134 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Polr1aO35134 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Polr1aO35134 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
Polr1aO35134 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Polr1aO35134 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Polr1aO35134 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Polr1aO35134 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Polr1aO35134 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Polr1aO35134 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Polr1aO35134 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Polr1aO35134 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Polr1aO35134 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Polr1aO35134 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Polr1aO35134 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Polr1aO35134 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Polr1aO35134 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Polr1aO35134 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Polr1aO35134 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Polr1aO35134 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Polr1aO35134 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Polr1aO35134 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Polr1aO35134 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Polr1aO35134 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Polr1aO35134 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Polr1aO35134 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Polr1aO35134 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Polr1aO35134 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Polr1aO35134 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Polr1aO35134 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Polr1aO35134 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Polr1aO35134 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Polr1aO35134 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Polr1aO35134 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Polr1aO35134 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Polr1aO35134 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Polr1aO35134 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Polr1aO35134 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Polr1aO35134 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Polr1aO35134 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Polr1aO35134 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Polr1aO35134 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Polr1aO35134 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Polr1aO35134 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Polr1aO35134 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Polr1aO35134 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Polr1aO35134 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Polr1aO35134 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
Polr1aO35134 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Polr1aO35134 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Polr1aO35134 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Polr1aO35134 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Polr1aO35134 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.05
Polr1aO35134 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
Polr1aO35134 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Polr1aO35134 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Polr1aO35134 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Polr1aO35134 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Polr1aO35134 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Polr1aO35134 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Polr1aO35134 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Polr1aO35134 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Polr1aO35134 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Polr1aO35134 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Polr1aO35134 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Polr1aO35134 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Polr1aO35134 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Polr1aO35134 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Polr1aO35134 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Polr1aO35134 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Polr1aO35134 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Polr1aO35134 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Polr1aO35134 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Polr1aO35134 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Polr1aO35134 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Polr1aO35134 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Polr1aO35134 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
Polr1aO35134 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Polr1aO35134 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Polr1aO35134 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Polr1aO35134 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Polr1aO35134 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Polr1aO35134 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Polr1aO35134 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Polr1aO35134 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms