Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
ArxO35085 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26,94■■□□□ 1,9
ArxO35085 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
ArxO35085 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
ArxO35085 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
ArxO35085 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
ArxO35085 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
ArxO35085 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC26,94■■□□□ 1,9
ArxO35085 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
ArxO35085 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26,93■■□□□ 1,9
ArxO35085 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
ArxO35085 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26,93■■□□□ 1,9
ArxO35085 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
ArxO35085 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
ArxO35085 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26,93■■□□□ 1,9
ArxO35085 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
ArxO35085 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
ArxO35085 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
ArxO35085 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
ArxO35085 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26,92■■□□□ 1,9
ArxO35085 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,91■■□□□ 1,9
ArxO35085 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
ArxO35085 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
ArxO35085 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,91■■□□□ 1,9
ArxO35085 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
ArxO35085 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26,9■■□□□ 1,9
ArxO35085 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
ArxO35085 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26,9■■□□□ 1,9
ArxO35085 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
ArxO35085 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
ArxO35085 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,9■■□□□ 1,9
ArxO35085 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
ArxO35085 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26,89■■□□□ 1,9
ArxO35085 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,89
ArxO35085 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,89
ArxO35085 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
ArxO35085 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
ArxO35085 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
ArxO35085 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26,88■■□□□ 1,89
ArxO35085 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
ArxO35085 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
ArxO35085 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
ArxO35085 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
ArxO35085 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
ArxO35085 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
ArxO35085 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
ArxO35085 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26,86■■□□□ 1,89
ArxO35085 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
ArxO35085 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
ArxO35085 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
ArxO35085 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
ArxO35085 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
ArxO35085 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
ArxO35085 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC26,85■■□□□ 1,89
ArxO35085 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
ArxO35085 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,84■■□□□ 1,89
ArxO35085 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
ArxO35085 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
ArxO35085 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
ArxO35085 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
ArxO35085 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26,83■■□□□ 1,89
ArxO35085 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,83■■□□□ 1,88
ArxO35085 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
ArxO35085 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,82■■□□□ 1,88
ArxO35085 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
ArxO35085 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26,82■■□□□ 1,88
ArxO35085 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
ArxO35085 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
ArxO35085 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
ArxO35085 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26,81■■□□□ 1,88
ArxO35085 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
ArxO35085 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
ArxO35085 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26,8■■□□□ 1,88
ArxO35085 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26,8■■□□□ 1,88
ArxO35085 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26,8■■□□□ 1,88
ArxO35085 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26,8■■□□□ 1,88
ArxO35085 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
ArxO35085 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
ArxO35085 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
ArxO35085 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26,79■■□□□ 1,88
ArxO35085 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
ArxO35085 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC26,79■■□□□ 1,88
ArxO35085 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
ArxO35085 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
ArxO35085 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
ArxO35085 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26,78■■□□□ 1,88
ArxO35085 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
ArxO35085 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
ArxO35085 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
ArxO35085 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
ArxO35085 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,77■■□□□ 1,88
ArxO35085 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
ArxO35085 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
ArxO35085 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
ArxO35085 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
ArxO35085 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
ArxO35085 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
ArxO35085 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
ArxO35085 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
ArxO35085 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40,8 ms