Protein–RNA interactions for Protein: O08792

Ebf2, Transcription factor COE2, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf2O08792 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ebf2O08792 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ebf2O08792 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ebf2O08792 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ebf2O08792 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ebf2O08792 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ebf2O08792 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ebf2O08792 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ebf2O08792 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ebf2O08792 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ebf2O08792 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ebf2O08792 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ebf2O08792 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ebf2O08792 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ebf2O08792 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ebf2O08792 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ebf2O08792 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ebf2O08792 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ebf2O08792 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ebf2O08792 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ebf2O08792 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ebf2O08792 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ebf2O08792 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ebf2O08792 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ebf2O08792 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ebf2O08792 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ebf2O08792 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ebf2O08792 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ebf2O08792 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ebf2O08792 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ebf2O08792 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ebf2O08792 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ebf2O08792 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ebf2O08792 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ebf2O08792 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ebf2O08792 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ebf2O08792 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ebf2O08792 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ebf2O08792 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ebf2O08792 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ebf2O08792 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ebf2O08792 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ebf2O08792 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ebf2O08792 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ebf2O08792 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ebf2O08792 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ebf2O08792 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ebf2O08792 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ebf2O08792 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ebf2O08792 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ebf2O08792 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ebf2O08792 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ebf2O08792 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ebf2O08792 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ebf2O08792 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ebf2O08792 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ebf2O08792 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ebf2O08792 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ebf2O08792 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ebf2O08792 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ebf2O08792 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ebf2O08792 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ebf2O08792 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ebf2O08792 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ebf2O08792 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ebf2O08792 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ebf2O08792 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ebf2O08792 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ebf2O08792 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ebf2O08792 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ebf2O08792 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ebf2O08792 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ebf2O08792 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ebf2O08792 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ebf2O08792 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ebf2O08792 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ebf2O08792 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ebf2O08792 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ebf2O08792 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ebf2O08792 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ebf2O08792 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ebf2O08792 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ebf2O08792 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ebf2O08792 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ebf2O08792 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ebf2O08792 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ebf2O08792 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ebf2O08792 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ebf2O08792 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ebf2O08792 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ebf2O08792 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ebf2O08792 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ebf2O08792 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ebf2O08792 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ebf2O08792 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ebf2O08792 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ebf2O08792 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ebf2O08792 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ebf2O08792 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ebf2O08792 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms