Protein–RNA interactions for Protein: O08791

Ebf3, Transcription factor COE3, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf3O08791 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ebf3O08791 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ebf3O08791 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ebf3O08791 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ebf3O08791 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ebf3O08791 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ebf3O08791 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ebf3O08791 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ebf3O08791 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ebf3O08791 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ebf3O08791 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ebf3O08791 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ebf3O08791 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ebf3O08791 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ebf3O08791 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ebf3O08791 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ebf3O08791 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ebf3O08791 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ebf3O08791 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ebf3O08791 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ebf3O08791 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ebf3O08791 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ebf3O08791 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ebf3O08791 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ebf3O08791 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ebf3O08791 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ebf3O08791 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ebf3O08791 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ebf3O08791 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ebf3O08791 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ebf3O08791 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ebf3O08791 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ebf3O08791 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ebf3O08791 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ebf3O08791 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ebf3O08791 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ebf3O08791 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ebf3O08791 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ebf3O08791 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ebf3O08791 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ebf3O08791 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ebf3O08791 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ebf3O08791 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ebf3O08791 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ebf3O08791 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ebf3O08791 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ebf3O08791 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ebf3O08791 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ebf3O08791 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ebf3O08791 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ebf3O08791 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ebf3O08791 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ebf3O08791 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ebf3O08791 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ebf3O08791 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ebf3O08791 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ebf3O08791 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ebf3O08791 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ebf3O08791 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ebf3O08791 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ebf3O08791 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ebf3O08791 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ebf3O08791 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ebf3O08791 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ebf3O08791 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ebf3O08791 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ebf3O08791 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ebf3O08791 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ebf3O08791 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ebf3O08791 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ebf3O08791 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ebf3O08791 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ebf3O08791 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ebf3O08791 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ebf3O08791 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ebf3O08791 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ebf3O08791 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ebf3O08791 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ebf3O08791 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ebf3O08791 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ebf3O08791 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ebf3O08791 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ebf3O08791 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ebf3O08791 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ebf3O08791 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ebf3O08791 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ebf3O08791 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ebf3O08791 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ebf3O08791 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ebf3O08791 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ebf3O08791 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ebf3O08791 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ebf3O08791 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ebf3O08791 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ebf3O08791 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ebf3O08791 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ebf3O08791 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ebf3O08791 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ebf3O08791 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ebf3O08791 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms