Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MsmbO08540 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MsmbO08540 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MsmbO08540 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MsmbO08540 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MsmbO08540 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MsmbO08540 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MsmbO08540 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MsmbO08540 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MsmbO08540 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MsmbO08540 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MsmbO08540 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MsmbO08540 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MsmbO08540 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MsmbO08540 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MsmbO08540 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MsmbO08540 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MsmbO08540 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MsmbO08540 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MsmbO08540 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MsmbO08540 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MsmbO08540 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MsmbO08540 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MsmbO08540 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MsmbO08540 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MsmbO08540 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MsmbO08540 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MsmbO08540 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MsmbO08540 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MsmbO08540 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MsmbO08540 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MsmbO08540 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MsmbO08540 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MsmbO08540 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MsmbO08540 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MsmbO08540 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MsmbO08540 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MsmbO08540 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MsmbO08540 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MsmbO08540 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MsmbO08540 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MsmbO08540 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MsmbO08540 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MsmbO08540 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MsmbO08540 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MsmbO08540 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MsmbO08540 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MsmbO08540 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MsmbO08540 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MsmbO08540 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MsmbO08540 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MsmbO08540 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MsmbO08540 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MsmbO08540 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MsmbO08540 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MsmbO08540 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MsmbO08540 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MsmbO08540 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MsmbO08540 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MsmbO08540 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MsmbO08540 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MsmbO08540 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MsmbO08540 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MsmbO08540 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MsmbO08540 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MsmbO08540 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MsmbO08540 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MsmbO08540 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MsmbO08540 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MsmbO08540 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MsmbO08540 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MsmbO08540 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MsmbO08540 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MsmbO08540 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MsmbO08540 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MsmbO08540 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MsmbO08540 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MsmbO08540 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MsmbO08540 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MsmbO08540 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MsmbO08540 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MsmbO08540 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MsmbO08540 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MsmbO08540 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MsmbO08540 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MsmbO08540 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MsmbO08540 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MsmbO08540 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MsmbO08540 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MsmbO08540 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MsmbO08540 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MsmbO08540 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MsmbO08540 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MsmbO08540 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MsmbO08540 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MsmbO08540 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MsmbO08540 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MsmbO08540 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MsmbO08540 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MsmbO08540 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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