Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smim18J3QNP2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smim18J3QNP2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smim18J3QNP2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Smim18J3QNP2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Smim18J3QNP2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smim18J3QNP2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smim18J3QNP2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smim18J3QNP2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Smim18J3QNP2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smim18J3QNP2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smim18J3QNP2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smim18J3QNP2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smim18J3QNP2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smim18J3QNP2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Smim18J3QNP2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smim18J3QNP2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smim18J3QNP2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smim18J3QNP2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smim18J3QNP2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smim18J3QNP2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smim18J3QNP2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smim18J3QNP2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smim18J3QNP2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smim18J3QNP2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smim18J3QNP2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smim18J3QNP2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smim18J3QNP2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smim18J3QNP2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smim18J3QNP2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smim18J3QNP2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smim18J3QNP2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smim18J3QNP2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smim18J3QNP2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smim18J3QNP2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smim18J3QNP2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smim18J3QNP2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smim18J3QNP2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smim18J3QNP2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smim18J3QNP2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smim18J3QNP2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smim18J3QNP2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smim18J3QNP2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smim18J3QNP2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smim18J3QNP2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smim18J3QNP2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smim18J3QNP2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smim18J3QNP2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smim18J3QNP2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smim18J3QNP2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smim18J3QNP2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smim18J3QNP2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim18J3QNP2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim18J3QNP2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim18J3QNP2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim18J3QNP2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim18J3QNP2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim18J3QNP2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim18J3QNP2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim18J3QNP2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim18J3QNP2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim18J3QNP2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smim18J3QNP2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smim18J3QNP2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smim18J3QNP2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smim18J3QNP2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smim18J3QNP2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smim18J3QNP2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smim18J3QNP2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smim18J3QNP2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smim18J3QNP2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smim18J3QNP2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smim18J3QNP2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smim18J3QNP2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smim18J3QNP2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smim18J3QNP2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Smim18J3QNP2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smim18J3QNP2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smim18J3QNP2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smim18J3QNP2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smim18J3QNP2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smim18J3QNP2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smim18J3QNP2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smim18J3QNP2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smim18J3QNP2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smim18J3QNP2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smim18J3QNP2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim18J3QNP2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim18J3QNP2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim18J3QNP2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim18J3QNP2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim18J3QNP2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim18J3QNP2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim18J3QNP2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim18J3QNP2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim18J3QNP2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smim18J3QNP2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smim18J3QNP2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smim18J3QNP2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smim18J3QNP2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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