Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
AK157302I3ITR1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
AK157302I3ITR1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
AK157302I3ITR1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
AK157302I3ITR1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
AK157302I3ITR1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
AK157302I3ITR1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
AK157302I3ITR1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
AK157302I3ITR1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
AK157302I3ITR1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
AK157302I3ITR1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
AK157302I3ITR1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
AK157302I3ITR1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
AK157302I3ITR1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
AK157302I3ITR1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
AK157302I3ITR1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
AK157302I3ITR1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
AK157302I3ITR1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
AK157302I3ITR1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
AK157302I3ITR1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
AK157302I3ITR1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
AK157302I3ITR1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
AK157302I3ITR1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
AK157302I3ITR1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
AK157302I3ITR1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
AK157302I3ITR1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
AK157302I3ITR1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
AK157302I3ITR1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
AK157302I3ITR1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
AK157302I3ITR1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
AK157302I3ITR1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
AK157302I3ITR1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
AK157302I3ITR1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
AK157302I3ITR1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
AK157302I3ITR1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
AK157302I3ITR1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
AK157302I3ITR1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
AK157302I3ITR1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
AK157302I3ITR1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
AK157302I3ITR1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
AK157302I3ITR1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AK157302I3ITR1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AK157302I3ITR1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AK157302I3ITR1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
AK157302I3ITR1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
AK157302I3ITR1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
AK157302I3ITR1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
AK157302I3ITR1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
AK157302I3ITR1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
AK157302I3ITR1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
AK157302I3ITR1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
AK157302I3ITR1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
AK157302I3ITR1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
AK157302I3ITR1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
AK157302I3ITR1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
AK157302I3ITR1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AK157302I3ITR1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
AK157302I3ITR1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
AK157302I3ITR1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AK157302I3ITR1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AK157302I3ITR1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
AK157302I3ITR1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
AK157302I3ITR1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
AK157302I3ITR1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
AK157302I3ITR1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
AK157302I3ITR1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
AK157302I3ITR1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
AK157302I3ITR1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
AK157302I3ITR1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
AK157302I3ITR1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
AK157302I3ITR1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
AK157302I3ITR1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
AK157302I3ITR1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
AK157302I3ITR1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
AK157302I3ITR1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
AK157302I3ITR1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AK157302I3ITR1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AK157302I3ITR1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AK157302I3ITR1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
AK157302I3ITR1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AK157302I3ITR1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
AK157302I3ITR1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
AK157302I3ITR1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
AK157302I3ITR1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
AK157302I3ITR1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
AK157302I3ITR1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
AK157302I3ITR1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
AK157302I3ITR1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
AK157302I3ITR1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
AK157302I3ITR1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AK157302I3ITR1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AK157302I3ITR1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AK157302I3ITR1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AK157302I3ITR1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
AK157302I3ITR1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
AK157302I3ITR1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AK157302I3ITR1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AK157302I3ITR1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AK157302I3ITR1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AK157302I3ITR1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95 ms