Protein–RNA interactions for Protein: G5E8S3

E230025N22Rik, Riken cDNA E230025N22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E230025N22RikG5E8S3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E230025N22RikG5E8S3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E230025N22RikG5E8S3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E230025N22RikG5E8S3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E230025N22RikG5E8S3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E230025N22RikG5E8S3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E230025N22RikG5E8S3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E230025N22RikG5E8S3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E230025N22RikG5E8S3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E230025N22RikG5E8S3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E230025N22RikG5E8S3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E230025N22RikG5E8S3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E230025N22RikG5E8S3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
E230025N22RikG5E8S3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E230025N22RikG5E8S3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
E230025N22RikG5E8S3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E230025N22RikG5E8S3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E230025N22RikG5E8S3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E230025N22RikG5E8S3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
E230025N22RikG5E8S3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E230025N22RikG5E8S3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
E230025N22RikG5E8S3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E230025N22RikG5E8S3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E230025N22RikG5E8S3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
E230025N22RikG5E8S3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E230025N22RikG5E8S3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E230025N22RikG5E8S3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
E230025N22RikG5E8S3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E230025N22RikG5E8S3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E230025N22RikG5E8S3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E230025N22RikG5E8S3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
E230025N22RikG5E8S3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E230025N22RikG5E8S3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E230025N22RikG5E8S3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E230025N22RikG5E8S3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E230025N22RikG5E8S3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E230025N22RikG5E8S3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E230025N22RikG5E8S3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E230025N22RikG5E8S3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E230025N22RikG5E8S3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E230025N22RikG5E8S3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
E230025N22RikG5E8S3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E230025N22RikG5E8S3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E230025N22RikG5E8S3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E230025N22RikG5E8S3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E230025N22RikG5E8S3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E230025N22RikG5E8S3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E230025N22RikG5E8S3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E230025N22RikG5E8S3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E230025N22RikG5E8S3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E230025N22RikG5E8S3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E230025N22RikG5E8S3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E230025N22RikG5E8S3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E230025N22RikG5E8S3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E230025N22RikG5E8S3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
E230025N22RikG5E8S3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E230025N22RikG5E8S3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E230025N22RikG5E8S3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E230025N22RikG5E8S3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E230025N22RikG5E8S3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
E230025N22RikG5E8S3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
E230025N22RikG5E8S3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
E230025N22RikG5E8S3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E230025N22RikG5E8S3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E230025N22RikG5E8S3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E230025N22RikG5E8S3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E230025N22RikG5E8S3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E230025N22RikG5E8S3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E230025N22RikG5E8S3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E230025N22RikG5E8S3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E230025N22RikG5E8S3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E230025N22RikG5E8S3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E230025N22RikG5E8S3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E230025N22RikG5E8S3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E230025N22RikG5E8S3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E230025N22RikG5E8S3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E230025N22RikG5E8S3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E230025N22RikG5E8S3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E230025N22RikG5E8S3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E230025N22RikG5E8S3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
E230025N22RikG5E8S3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E230025N22RikG5E8S3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E230025N22RikG5E8S3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E230025N22RikG5E8S3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E230025N22RikG5E8S3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E230025N22RikG5E8S3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E230025N22RikG5E8S3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
E230025N22RikG5E8S3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
E230025N22RikG5E8S3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E230025N22RikG5E8S3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E230025N22RikG5E8S3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E230025N22RikG5E8S3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E230025N22RikG5E8S3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
E230025N22RikG5E8S3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
E230025N22RikG5E8S3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
E230025N22RikG5E8S3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
E230025N22RikG5E8S3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E230025N22RikG5E8S3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
E230025N22RikG5E8S3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
E230025N22RikG5E8S3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms