Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Tubgcp6G5E8P0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Tubgcp6G5E8P0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Tubgcp6G5E8P0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Tubgcp6G5E8P0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Tubgcp6G5E8P0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Tubgcp6G5E8P0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Tubgcp6G5E8P0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Tubgcp6G5E8P0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Tubgcp6G5E8P0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Tubgcp6G5E8P0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Tubgcp6G5E8P0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Tubgcp6G5E8P0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Tubgcp6G5E8P0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Tubgcp6G5E8P0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Tubgcp6G5E8P0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Tubgcp6G5E8P0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Tubgcp6G5E8P0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Tubgcp6G5E8P0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Tubgcp6G5E8P0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Tubgcp6G5E8P0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Tubgcp6G5E8P0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Tubgcp6G5E8P0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Tubgcp6G5E8P0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Tubgcp6G5E8P0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Tubgcp6G5E8P0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Tubgcp6G5E8P0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Tubgcp6G5E8P0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Tubgcp6G5E8P0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Tubgcp6G5E8P0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Tubgcp6G5E8P0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Tubgcp6G5E8P0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Tubgcp6G5E8P0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Tubgcp6G5E8P0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Tubgcp6G5E8P0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Tubgcp6G5E8P0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Tubgcp6G5E8P0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Tubgcp6G5E8P0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Tubgcp6G5E8P0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Tubgcp6G5E8P0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Tubgcp6G5E8P0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
Tubgcp6G5E8P0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Tubgcp6G5E8P0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Tubgcp6G5E8P0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Tubgcp6G5E8P0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Tubgcp6G5E8P0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Tubgcp6G5E8P0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Tubgcp6G5E8P0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Tubgcp6G5E8P0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Tubgcp6G5E8P0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Tubgcp6G5E8P0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Tubgcp6G5E8P0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Tubgcp6G5E8P0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Tubgcp6G5E8P0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Tubgcp6G5E8P0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Tubgcp6G5E8P0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Tubgcp6G5E8P0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Tubgcp6G5E8P0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Tubgcp6G5E8P0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Tubgcp6G5E8P0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Tubgcp6G5E8P0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Tubgcp6G5E8P0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Tubgcp6G5E8P0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Tubgcp6G5E8P0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Tubgcp6G5E8P0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Tubgcp6G5E8P0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Tubgcp6G5E8P0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Tubgcp6G5E8P0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Tubgcp6G5E8P0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Tubgcp6G5E8P0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Tubgcp6G5E8P0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Tubgcp6G5E8P0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Tubgcp6G5E8P0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Tubgcp6G5E8P0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Tubgcp6G5E8P0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Tubgcp6G5E8P0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Tubgcp6G5E8P0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Tubgcp6G5E8P0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Tubgcp6G5E8P0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Tubgcp6G5E8P0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Tubgcp6G5E8P0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Tubgcp6G5E8P0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Tubgcp6G5E8P0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Tubgcp6G5E8P0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Tubgcp6G5E8P0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Tubgcp6G5E8P0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Tubgcp6G5E8P0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Tubgcp6G5E8P0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Tubgcp6G5E8P0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Tubgcp6G5E8P0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Tubgcp6G5E8P0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Tubgcp6G5E8P0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Tubgcp6G5E8P0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Tubgcp6G5E8P0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Tubgcp6G5E8P0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Tubgcp6G5E8P0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Tubgcp6G5E8P0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Tubgcp6G5E8P0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Tubgcp6G5E8P0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Tubgcp6G5E8P0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms