Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Pcf11G3X9Z4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Pcf11G3X9Z4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Pcf11G3X9Z4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Pcf11G3X9Z4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Pcf11G3X9Z4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Pcf11G3X9Z4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Pcf11G3X9Z4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Pcf11G3X9Z4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Pcf11G3X9Z4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Pcf11G3X9Z4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Pcf11G3X9Z4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Pcf11G3X9Z4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Pcf11G3X9Z4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Pcf11G3X9Z4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Pcf11G3X9Z4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Pcf11G3X9Z4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Pcf11G3X9Z4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Pcf11G3X9Z4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Pcf11G3X9Z4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Pcf11G3X9Z4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Pcf11G3X9Z4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Pcf11G3X9Z4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Pcf11G3X9Z4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Pcf11G3X9Z4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Pcf11G3X9Z4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Pcf11G3X9Z4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Pcf11G3X9Z4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Pcf11G3X9Z4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Pcf11G3X9Z4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Pcf11G3X9Z4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Pcf11G3X9Z4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Pcf11G3X9Z4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Pcf11G3X9Z4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Pcf11G3X9Z4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Pcf11G3X9Z4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Pcf11G3X9Z4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Pcf11G3X9Z4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Pcf11G3X9Z4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Pcf11G3X9Z4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.97
Pcf11G3X9Z4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
Pcf11G3X9Z4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Pcf11G3X9Z4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Pcf11G3X9Z4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Pcf11G3X9Z4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Pcf11G3X9Z4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Pcf11G3X9Z4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Pcf11G3X9Z4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Pcf11G3X9Z4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Pcf11G3X9Z4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Pcf11G3X9Z4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Pcf11G3X9Z4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Pcf11G3X9Z4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Pcf11G3X9Z4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Pcf11G3X9Z4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Pcf11G3X9Z4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Pcf11G3X9Z4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Pcf11G3X9Z4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Pcf11G3X9Z4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Pcf11G3X9Z4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Pcf11G3X9Z4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Pcf11G3X9Z4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Pcf11G3X9Z4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Pcf11G3X9Z4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Pcf11G3X9Z4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Pcf11G3X9Z4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Pcf11G3X9Z4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Pcf11G3X9Z4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Pcf11G3X9Z4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Pcf11G3X9Z4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Pcf11G3X9Z4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Pcf11G3X9Z4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Pcf11G3X9Z4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Pcf11G3X9Z4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Pcf11G3X9Z4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Pcf11G3X9Z4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Pcf11G3X9Z4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Pcf11G3X9Z4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Pcf11G3X9Z4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Pcf11G3X9Z4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Pcf11G3X9Z4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Pcf11G3X9Z4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Pcf11G3X9Z4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Pcf11G3X9Z4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Pcf11G3X9Z4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
Pcf11G3X9Z4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Pcf11G3X9Z4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Pcf11G3X9Z4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Pcf11G3X9Z4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Pcf11G3X9Z4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Pcf11G3X9Z4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Pcf11G3X9Z4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Pcf11G3X9Z4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Pcf11G3X9Z4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Pcf11G3X9Z4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Pcf11G3X9Z4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Pcf11G3X9Z4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Pcf11G3X9Z4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Pcf11G3X9Z4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Pcf11G3X9Z4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms