Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf148G3X9R7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf148G3X9R7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf148G3X9R7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf148G3X9R7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf148G3X9R7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf148G3X9R7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf148G3X9R7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf148G3X9R7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf148G3X9R7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf148G3X9R7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf148G3X9R7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf148G3X9R7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf148G3X9R7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf148G3X9R7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf148G3X9R7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf148G3X9R7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf148G3X9R7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf148G3X9R7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf148G3X9R7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf148G3X9R7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf148G3X9R7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf148G3X9R7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf148G3X9R7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf148G3X9R7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf148G3X9R7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf148G3X9R7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf148G3X9R7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf148G3X9R7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rnf148G3X9R7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rnf148G3X9R7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rnf148G3X9R7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf148G3X9R7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf148G3X9R7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf148G3X9R7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf148G3X9R7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf148G3X9R7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf148G3X9R7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf148G3X9R7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf148G3X9R7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf148G3X9R7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf148G3X9R7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf148G3X9R7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf148G3X9R7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf148G3X9R7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf148G3X9R7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf148G3X9R7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf148G3X9R7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf148G3X9R7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf148G3X9R7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf148G3X9R7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf148G3X9R7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf148G3X9R7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf148G3X9R7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf148G3X9R7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf148G3X9R7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf148G3X9R7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf148G3X9R7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf148G3X9R7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf148G3X9R7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf148G3X9R7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf148G3X9R7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf148G3X9R7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf148G3X9R7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf148G3X9R7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf148G3X9R7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf148G3X9R7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf148G3X9R7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnf148G3X9R7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnf148G3X9R7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnf148G3X9R7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnf148G3X9R7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rnf148G3X9R7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rnf148G3X9R7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rnf148G3X9R7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rnf148G3X9R7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rnf148G3X9R7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rnf148G3X9R7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf148G3X9R7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf148G3X9R7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf148G3X9R7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf148G3X9R7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf148G3X9R7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf148G3X9R7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf148G3X9R7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf148G3X9R7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf148G3X9R7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf148G3X9R7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf148G3X9R7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf148G3X9R7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf148G3X9R7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf148G3X9R7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf148G3X9R7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf148G3X9R7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf148G3X9R7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf148G3X9R7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf148G3X9R7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf148G3X9R7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf148G3X9R7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf148G3X9R7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms