Protein–RNA interactions for Protein: G3X9I7

Zc3h12b, MCG2522, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h12bG3X9I7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zc3h12bG3X9I7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zc3h12bG3X9I7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zc3h12bG3X9I7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zc3h12bG3X9I7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zc3h12bG3X9I7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Zc3h12bG3X9I7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zc3h12bG3X9I7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zc3h12bG3X9I7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zc3h12bG3X9I7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zc3h12bG3X9I7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Zc3h12bG3X9I7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zc3h12bG3X9I7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zc3h12bG3X9I7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zc3h12bG3X9I7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zc3h12bG3X9I7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zc3h12bG3X9I7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zc3h12bG3X9I7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zc3h12bG3X9I7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zc3h12bG3X9I7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zc3h12bG3X9I7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zc3h12bG3X9I7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zc3h12bG3X9I7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zc3h12bG3X9I7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zc3h12bG3X9I7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zc3h12bG3X9I7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zc3h12bG3X9I7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zc3h12bG3X9I7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zc3h12bG3X9I7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zc3h12bG3X9I7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zc3h12bG3X9I7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zc3h12bG3X9I7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zc3h12bG3X9I7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zc3h12bG3X9I7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zc3h12bG3X9I7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zc3h12bG3X9I7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zc3h12bG3X9I7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Zc3h12bG3X9I7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zc3h12bG3X9I7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zc3h12bG3X9I7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zc3h12bG3X9I7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zc3h12bG3X9I7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zc3h12bG3X9I7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zc3h12bG3X9I7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zc3h12bG3X9I7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zc3h12bG3X9I7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zc3h12bG3X9I7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zc3h12bG3X9I7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zc3h12bG3X9I7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Zc3h12bG3X9I7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Zc3h12bG3X9I7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zc3h12bG3X9I7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Zc3h12bG3X9I7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Zc3h12bG3X9I7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zc3h12bG3X9I7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zc3h12bG3X9I7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zc3h12bG3X9I7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zc3h12bG3X9I7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zc3h12bG3X9I7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zc3h12bG3X9I7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zc3h12bG3X9I7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zc3h12bG3X9I7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zc3h12bG3X9I7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Zc3h12bG3X9I7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zc3h12bG3X9I7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zc3h12bG3X9I7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Zc3h12bG3X9I7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zc3h12bG3X9I7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zc3h12bG3X9I7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zc3h12bG3X9I7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zc3h12bG3X9I7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zc3h12bG3X9I7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zc3h12bG3X9I7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zc3h12bG3X9I7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zc3h12bG3X9I7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zc3h12bG3X9I7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zc3h12bG3X9I7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zc3h12bG3X9I7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zc3h12bG3X9I7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zc3h12bG3X9I7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zc3h12bG3X9I7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zc3h12bG3X9I7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zc3h12bG3X9I7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Zc3h12bG3X9I7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zc3h12bG3X9I7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zc3h12bG3X9I7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zc3h12bG3X9I7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zc3h12bG3X9I7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zc3h12bG3X9I7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zc3h12bG3X9I7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zc3h12bG3X9I7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zc3h12bG3X9I7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zc3h12bG3X9I7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zc3h12bG3X9I7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Zc3h12bG3X9I7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zc3h12bG3X9I7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zc3h12bG3X9I7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zc3h12bG3X9I7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zc3h12bG3X9I7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zc3h12bG3X9I7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms