Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sh3tc1G3X9F6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sh3tc1G3X9F6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sh3tc1G3X9F6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sh3tc1G3X9F6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sh3tc1G3X9F6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sh3tc1G3X9F6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sh3tc1G3X9F6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sh3tc1G3X9F6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sh3tc1G3X9F6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sh3tc1G3X9F6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sh3tc1G3X9F6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sh3tc1G3X9F6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sh3tc1G3X9F6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sh3tc1G3X9F6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sh3tc1G3X9F6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sh3tc1G3X9F6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sh3tc1G3X9F6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sh3tc1G3X9F6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Sh3tc1G3X9F6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sh3tc1G3X9F6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sh3tc1G3X9F6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Sh3tc1G3X9F6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sh3tc1G3X9F6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sh3tc1G3X9F6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sh3tc1G3X9F6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sh3tc1G3X9F6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sh3tc1G3X9F6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sh3tc1G3X9F6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sh3tc1G3X9F6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sh3tc1G3X9F6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sh3tc1G3X9F6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Sh3tc1G3X9F6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sh3tc1G3X9F6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sh3tc1G3X9F6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sh3tc1G3X9F6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Sh3tc1G3X9F6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sh3tc1G3X9F6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sh3tc1G3X9F6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sh3tc1G3X9F6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sh3tc1G3X9F6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sh3tc1G3X9F6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sh3tc1G3X9F6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sh3tc1G3X9F6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sh3tc1G3X9F6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sh3tc1G3X9F6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sh3tc1G3X9F6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sh3tc1G3X9F6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sh3tc1G3X9F6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sh3tc1G3X9F6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sh3tc1G3X9F6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sh3tc1G3X9F6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sh3tc1G3X9F6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sh3tc1G3X9F6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sh3tc1G3X9F6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Sh3tc1G3X9F6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
Sh3tc1G3X9F6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Sh3tc1G3X9F6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Sh3tc1G3X9F6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Sh3tc1G3X9F6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sh3tc1G3X9F6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Sh3tc1G3X9F6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sh3tc1G3X9F6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sh3tc1G3X9F6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sh3tc1G3X9F6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sh3tc1G3X9F6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sh3tc1G3X9F6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sh3tc1G3X9F6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sh3tc1G3X9F6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sh3tc1G3X9F6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Sh3tc1G3X9F6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sh3tc1G3X9F6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sh3tc1G3X9F6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sh3tc1G3X9F6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sh3tc1G3X9F6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sh3tc1G3X9F6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sh3tc1G3X9F6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sh3tc1G3X9F6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sh3tc1G3X9F6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sh3tc1G3X9F6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sh3tc1G3X9F6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sh3tc1G3X9F6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sh3tc1G3X9F6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sh3tc1G3X9F6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sh3tc1G3X9F6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sh3tc1G3X9F6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sh3tc1G3X9F6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sh3tc1G3X9F6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sh3tc1G3X9F6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sh3tc1G3X9F6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sh3tc1G3X9F6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sh3tc1G3X9F6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sh3tc1G3X9F6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sh3tc1G3X9F6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sh3tc1G3X9F6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sh3tc1G3X9F6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sh3tc1G3X9F6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sh3tc1G3X9F6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sh3tc1G3X9F6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sh3tc1G3X9F6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.8 ms