Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r39G3UWE6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r39G3UWE6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r39G3UWE6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Vmn1r39G3UWE6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r39G3UWE6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r39G3UWE6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r39G3UWE6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r39G3UWE6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r39G3UWE6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r39G3UWE6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r39G3UWE6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r39G3UWE6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r39G3UWE6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r39G3UWE6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r39G3UWE6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r39G3UWE6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r39G3UWE6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r39G3UWE6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r39G3UWE6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r39G3UWE6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r39G3UWE6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r39G3UWE6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r39G3UWE6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r39G3UWE6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r39G3UWE6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r39G3UWE6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r39G3UWE6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r39G3UWE6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r39G3UWE6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r39G3UWE6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r39G3UWE6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r39G3UWE6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r39G3UWE6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r39G3UWE6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r39G3UWE6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r39G3UWE6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r39G3UWE6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r39G3UWE6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r39G3UWE6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r39G3UWE6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r39G3UWE6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r39G3UWE6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r39G3UWE6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r39G3UWE6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r39G3UWE6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r39G3UWE6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r39G3UWE6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r39G3UWE6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r39G3UWE6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r39G3UWE6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r39G3UWE6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r39G3UWE6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r39G3UWE6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r39G3UWE6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r39G3UWE6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r39G3UWE6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r39G3UWE6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r39G3UWE6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r39G3UWE6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r39G3UWE6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r39G3UWE6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r39G3UWE6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r39G3UWE6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r39G3UWE6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r39G3UWE6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r39G3UWE6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r39G3UWE6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r39G3UWE6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r39G3UWE6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r39G3UWE6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r39G3UWE6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r39G3UWE6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r39G3UWE6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r39G3UWE6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r39G3UWE6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r39G3UWE6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r39G3UWE6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r39G3UWE6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r39G3UWE6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r39G3UWE6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r39G3UWE6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r39G3UWE6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r39G3UWE6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r39G3UWE6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r39G3UWE6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r39G3UWE6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r39G3UWE6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r39G3UWE6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r39G3UWE6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r39G3UWE6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r39G3UWE6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r39G3UWE6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r39G3UWE6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r39G3UWE6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vmn1r39G3UWE6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn1r39G3UWE6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn1r39G3UWE6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn1r39G3UWE6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r39G3UWE6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms