Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ScaperF8VQ70 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ScaperF8VQ70 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ScaperF8VQ70 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ScaperF8VQ70 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ScaperF8VQ70 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ScaperF8VQ70 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ScaperF8VQ70 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ScaperF8VQ70 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ScaperF8VQ70 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ScaperF8VQ70 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ScaperF8VQ70 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ScaperF8VQ70 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ScaperF8VQ70 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ScaperF8VQ70 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ScaperF8VQ70 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ScaperF8VQ70 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ScaperF8VQ70 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ScaperF8VQ70 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ScaperF8VQ70 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ScaperF8VQ70 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ScaperF8VQ70 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ScaperF8VQ70 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ScaperF8VQ70 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ScaperF8VQ70 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ScaperF8VQ70 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ScaperF8VQ70 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
ScaperF8VQ70 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ScaperF8VQ70 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ScaperF8VQ70 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ScaperF8VQ70 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ScaperF8VQ70 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ScaperF8VQ70 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
ScaperF8VQ70 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ScaperF8VQ70 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ScaperF8VQ70 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ScaperF8VQ70 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ScaperF8VQ70 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ScaperF8VQ70 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ScaperF8VQ70 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ScaperF8VQ70 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
ScaperF8VQ70 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ScaperF8VQ70 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ScaperF8VQ70 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ScaperF8VQ70 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ScaperF8VQ70 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ScaperF8VQ70 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ScaperF8VQ70 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
ScaperF8VQ70 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ScaperF8VQ70 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ScaperF8VQ70 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ScaperF8VQ70 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ScaperF8VQ70 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ScaperF8VQ70 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ScaperF8VQ70 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ScaperF8VQ70 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ScaperF8VQ70 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ScaperF8VQ70 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ScaperF8VQ70 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ScaperF8VQ70 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ScaperF8VQ70 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ScaperF8VQ70 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ScaperF8VQ70 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ScaperF8VQ70 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ScaperF8VQ70 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ScaperF8VQ70 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ScaperF8VQ70 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ScaperF8VQ70 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ScaperF8VQ70 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ScaperF8VQ70 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ScaperF8VQ70 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ScaperF8VQ70 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ScaperF8VQ70 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ScaperF8VQ70 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ScaperF8VQ70 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ScaperF8VQ70 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ScaperF8VQ70 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ScaperF8VQ70 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ScaperF8VQ70 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ScaperF8VQ70 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ScaperF8VQ70 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ScaperF8VQ70 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ScaperF8VQ70 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ScaperF8VQ70 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ScaperF8VQ70 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ScaperF8VQ70 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ScaperF8VQ70 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ScaperF8VQ70 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ScaperF8VQ70 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ScaperF8VQ70 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ScaperF8VQ70 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ScaperF8VQ70 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ScaperF8VQ70 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ScaperF8VQ70 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ScaperF8VQ70 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ScaperF8VQ70 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ScaperF8VQ70 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ScaperF8VQ70 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ScaperF8VQ70 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ScaperF8VQ70 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms