Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ63

Vmn1r76, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r76F8VQ63 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r76F8VQ63 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r76F8VQ63 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r76F8VQ63 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r76F8VQ63 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r76F8VQ63 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r76F8VQ63 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r76F8VQ63 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r76F8VQ63 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r76F8VQ63 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r76F8VQ63 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r76F8VQ63 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r76F8VQ63 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r76F8VQ63 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r76F8VQ63 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r76F8VQ63 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r76F8VQ63 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r76F8VQ63 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r76F8VQ63 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r76F8VQ63 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r76F8VQ63 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r76F8VQ63 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r76F8VQ63 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r76F8VQ63 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r76F8VQ63 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r76F8VQ63 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r76F8VQ63 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r76F8VQ63 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r76F8VQ63 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r76F8VQ63 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r76F8VQ63 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r76F8VQ63 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r76F8VQ63 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r76F8VQ63 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r76F8VQ63 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r76F8VQ63 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r76F8VQ63 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r76F8VQ63 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r76F8VQ63 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r76F8VQ63 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r76F8VQ63 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r76F8VQ63 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r76F8VQ63 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r76F8VQ63 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r76F8VQ63 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r76F8VQ63 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r76F8VQ63 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r76F8VQ63 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r76F8VQ63 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r76F8VQ63 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r76F8VQ63 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r76F8VQ63 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r76F8VQ63 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r76F8VQ63 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r76F8VQ63 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r76F8VQ63 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r76F8VQ63 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r76F8VQ63 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r76F8VQ63 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vmn1r76F8VQ63 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vmn1r76F8VQ63 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn1r76F8VQ63 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn1r76F8VQ63 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn1r76F8VQ63 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r76F8VQ63 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r76F8VQ63 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r76F8VQ63 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r76F8VQ63 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r76F8VQ63 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r76F8VQ63 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r76F8VQ63 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r76F8VQ63 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r76F8VQ63 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r76F8VQ63 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r76F8VQ63 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r76F8VQ63 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r76F8VQ63 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r76F8VQ63 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r76F8VQ63 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r76F8VQ63 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r76F8VQ63 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r76F8VQ63 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r76F8VQ63 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r76F8VQ63 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r76F8VQ63 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r76F8VQ63 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r76F8VQ63 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r76F8VQ63 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r76F8VQ63 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn1r76F8VQ63 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn1r76F8VQ63 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn1r76F8VQ63 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn1r76F8VQ63 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn1r76F8VQ63 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn1r76F8VQ63 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn1r76F8VQ63 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vmn1r76F8VQ63 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vmn1r76F8VQ63 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vmn1r76F8VQ63 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Vmn1r76F8VQ63 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms