Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Crocc2F6XLV1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Crocc2F6XLV1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Crocc2F6XLV1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Crocc2F6XLV1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Crocc2F6XLV1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Crocc2F6XLV1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
Crocc2F6XLV1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Crocc2F6XLV1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Crocc2F6XLV1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Crocc2F6XLV1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Crocc2F6XLV1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Crocc2F6XLV1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Crocc2F6XLV1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Crocc2F6XLV1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Crocc2F6XLV1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Crocc2F6XLV1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Crocc2F6XLV1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Crocc2F6XLV1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
Crocc2F6XLV1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Crocc2F6XLV1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Crocc2F6XLV1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Crocc2F6XLV1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Crocc2F6XLV1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Crocc2F6XLV1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Crocc2F6XLV1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Crocc2F6XLV1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Crocc2F6XLV1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Crocc2F6XLV1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Crocc2F6XLV1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Crocc2F6XLV1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Crocc2F6XLV1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Crocc2F6XLV1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Crocc2F6XLV1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Crocc2F6XLV1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
Crocc2F6XLV1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Crocc2F6XLV1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Crocc2F6XLV1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Crocc2F6XLV1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Crocc2F6XLV1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Crocc2F6XLV1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
Crocc2F6XLV1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Crocc2F6XLV1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Crocc2F6XLV1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Crocc2F6XLV1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
Crocc2F6XLV1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Crocc2F6XLV1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Crocc2F6XLV1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Crocc2F6XLV1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Crocc2F6XLV1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Crocc2F6XLV1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Crocc2F6XLV1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
Crocc2F6XLV1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Crocc2F6XLV1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Crocc2F6XLV1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Crocc2F6XLV1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Crocc2F6XLV1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Crocc2F6XLV1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Crocc2F6XLV1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
Crocc2F6XLV1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Crocc2F6XLV1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Crocc2F6XLV1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Crocc2F6XLV1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
Crocc2F6XLV1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Crocc2F6XLV1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Crocc2F6XLV1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Crocc2F6XLV1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Crocc2F6XLV1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Crocc2F6XLV1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Crocc2F6XLV1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Crocc2F6XLV1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
Crocc2F6XLV1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Crocc2F6XLV1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Crocc2F6XLV1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Crocc2F6XLV1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Crocc2F6XLV1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
Crocc2F6XLV1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Crocc2F6XLV1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Crocc2F6XLV1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Crocc2F6XLV1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Crocc2F6XLV1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Crocc2F6XLV1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Crocc2F6XLV1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Crocc2F6XLV1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Crocc2F6XLV1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Crocc2F6XLV1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Crocc2F6XLV1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Crocc2F6XLV1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Crocc2F6XLV1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Crocc2F6XLV1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Crocc2F6XLV1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Crocc2F6XLV1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Crocc2F6XLV1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Crocc2F6XLV1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Crocc2F6XLV1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Crocc2F6XLV1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Crocc2F6XLV1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Crocc2F6XLV1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Crocc2F6XLV1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Crocc2F6XLV1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms