Protein–RNA interactions for Protein: F6SKY8

Gm3072, Predicted gene 3072 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3072F6SKY8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3072F6SKY8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3072F6SKY8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3072F6SKY8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3072F6SKY8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm3072F6SKY8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3072F6SKY8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3072F6SKY8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3072F6SKY8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3072F6SKY8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3072F6SKY8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3072F6SKY8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3072F6SKY8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3072F6SKY8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3072F6SKY8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3072F6SKY8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3072F6SKY8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3072F6SKY8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3072F6SKY8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3072F6SKY8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3072F6SKY8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3072F6SKY8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3072F6SKY8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3072F6SKY8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3072F6SKY8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3072F6SKY8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3072F6SKY8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3072F6SKY8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3072F6SKY8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3072F6SKY8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3072F6SKY8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3072F6SKY8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3072F6SKY8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3072F6SKY8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3072F6SKY8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3072F6SKY8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3072F6SKY8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3072F6SKY8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3072F6SKY8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3072F6SKY8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3072F6SKY8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3072F6SKY8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3072F6SKY8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3072F6SKY8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3072F6SKY8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3072F6SKY8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3072F6SKY8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3072F6SKY8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm3072F6SKY8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3072F6SKY8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3072F6SKY8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3072F6SKY8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3072F6SKY8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3072F6SKY8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3072F6SKY8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3072F6SKY8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3072F6SKY8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3072F6SKY8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3072F6SKY8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3072F6SKY8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3072F6SKY8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3072F6SKY8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3072F6SKY8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3072F6SKY8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3072F6SKY8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3072F6SKY8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3072F6SKY8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3072F6SKY8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3072F6SKY8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3072F6SKY8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3072F6SKY8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3072F6SKY8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3072F6SKY8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3072F6SKY8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3072F6SKY8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3072F6SKY8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3072F6SKY8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3072F6SKY8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3072F6SKY8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3072F6SKY8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3072F6SKY8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3072F6SKY8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3072F6SKY8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3072F6SKY8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3072F6SKY8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3072F6SKY8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3072F6SKY8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3072F6SKY8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3072F6SKY8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3072F6SKY8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3072F6SKY8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3072F6SKY8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3072F6SKY8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3072F6SKY8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3072F6SKY8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3072F6SKY8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3072F6SKY8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3072F6SKY8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3072F6SKY8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3072F6SKY8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms